利用對接分類預測人類血漿白蛋白結合率.pdf

1、小分子的代謝動力學特征(ADME)決定著化合物在生物體內能否真正達到生物學作用，已經成為是藥物臨床前研究的重要考量因素。目前導致藥物不能成功上市的原因中，40％是由于ADME性質不佳所造成的。為了有效降低藥物的淘汰率，降低藥物開發(fā)成本，高通量的測定候選藥物前體的性質，計算機ADME建模成為了值得研究的重要途徑。
　　 目前的ADME建模方法主要是利用定量結構活性關系模型，所用的描述符基本上都基于小分子結構。以前研究證明，分子對接

2、可以分析小分子與蛋白之間的相互作用，可以用藥物活性的分類預測。然而，但很少有研究用于藥物動力學的定量活性預測。因此，本研究主要以人類血漿白蛋白結合率研究為例，探索對接分數能否作為描述符用于定量建模預測。
　　 第一部分利用傳統(tǒng)的小分子結構描述符來進行人類血漿白蛋白結合率(logK'HAS)的預測。所得模型結果為Q2=0.84，MSE=0.06；r2=0.83，mse=0.06；R2=0.87，mse=0.05。與前人所報導的模型

3、相比，這些預測能力要稍好一些，證明我們可以重復前人的工作并達到相似或者更好的結果。
　　 第二部分使用對接軟件利用小分子結構和蛋白質結構計算對接分數。然后將這些對接分數進行整合，基于計算所得對接分數描述符來建立模型預測logK'HAS，最終所得的模型結果為r2=0.78，mse=0.09；Q2=0.75，MSE=0.09；R2=0.79，mse=0.07。該結果可以與前人報導的模型達到相似的結果，很好地證明了對接分數可以作為描述