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文檔簡(jiǎn)介
1、目的: 建立心肌細(xì)胞糖酵解的數(shù)理模型,為更好的了解糖酵解的調(diào)控機(jī)制打下基礎(chǔ)。
方法: 為了建立合理的模型,首先從文獻(xiàn)中收集所需動(dòng)力學(xué)參數(shù)和代謝物穩(wěn)態(tài)濃度。然后用King-Altman圖解法獲得多底物酶促反應(yīng)的穩(wěn)態(tài)速度方程。根據(jù)已知條件和實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)通過軟件OriginPro8對(duì)穩(wěn)態(tài)速度方程的參數(shù)進(jìn)行校正,用Java語(yǔ)言和XML語(yǔ)言對(duì)糖酵解過程進(jìn)行編程。最后根據(jù)一些實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)來(lái)檢驗(yàn)?zāi)P偷暮侠硇裕⒛M改變某些條件后對(duì)各酶活性和對(duì)各代謝
2、物的影響。
結(jié)果: 己糖激酶、磷酸果糖激酶-1、3-磷酸甘油醛脫氫酶、丙酮酸脫氫酶、乳酸脫氫酶幾個(gè)關(guān)鍵酶和葡萄糖轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白4(GLUT4)、乳酸的單羧酸轉(zhuǎn)運(yùn)體(MCT)兩個(gè)轉(zhuǎn)運(yùn)體模型與實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)較為一致,模型擬合效果佳。整體模擬研究發(fā)現(xiàn)包含乳酸的心肌細(xì)胞糖酵解各代謝物最終達(dá)到平衡。若不包含乳酸會(huì)出現(xiàn)丙酮酸累積,同時(shí)如果降低GLUT4的最大轉(zhuǎn)運(yùn)速度到原來(lái)的1/10,丙酮酸會(huì)因?yàn)樘墙徒庵兄苟V乖黾?。另外,?dāng)ATP的消耗提高5倍后,糖
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