HepG2肝癌細胞及正常人肝細胞(Hl-7702)的microRNA-mRNA表達譜差異關(guān)聯(lián)分析.pdf

1、MicroRNA(miRNA)和mRNA共同構(gòu)成了一個重要的基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，在動物發(fā)育、細胞分化及代謝中起著重要的作用。復(fù)雜疾病的發(fā)生發(fā)展與microRNA（miRNA）有密切關(guān)系，研究miRNA與其靶基因（mRNA）在復(fù)雜疾病中的協(xié)同作用機制是一項具有挑戰(zhàn)意義的課題。近期的研究表明它們還與腫瘤的發(fā)生有著極其重要的關(guān)聯(lián)。本論文利用新一代高通量測序儀，對肝癌細胞HepG2和正常肝細胞HL-7702的miRNA和mRNA同時進行全基因組表達譜

2、測序，通過生物信息學分析方法獲得miRNA和mRNA的表達譜數(shù)據(jù)，綜合利用靶標預(yù)測以及各種基因表達譜的關(guān)聯(lián)分析手段，對兩種細胞的miRNA和mRNA進行全基因組范圍的表達差異關(guān)聯(lián)分析，試圖更全面了解肝細胞與腫瘤細胞之間的與腫瘤發(fā)生、發(fā)展相關(guān)聯(lián)的miRNA和mRNA的參與通路情況，用以闡明miRNA調(diào)節(jié)各種基因的表達水平與腫瘤發(fā)生的關(guān)系，篩選特定miRNA作為腫瘤的早期診斷標志物、惡性評估及預(yù)后的判斷指標等，并可以用于篩選能夠控制瘤生長的

3、生物小分子藥物。本課題目前主要完成了以下幾點研究內(nèi)容:
　　1.本文對HepG2肝癌細胞和HL-7702肝正常細胞的miRNA進行了表達譜差異分析。首先挑選出log2(fold-change)＞1或＜-1、p-value＜0.05的差異表達的miRNA。然后通過GO功能注釋發(fā)現(xiàn)在上下調(diào)的miRNA中均存在大量與細胞生長、細胞分化、細胞增殖、細胞死亡等生物過程相關(guān)。針對這些與細胞死亡、細胞分化等相關(guān)的miRNA進一步分析，發(fā)現(xiàn)他們主

4、要在p53信號通路、Rb信號通路、經(jīng)典Wnt信號通路等發(fā)揮作用。
　　2.本文對HepG2肝癌細胞和HL-7702肝正常細胞的mRNA進行了表達譜差異分析。首先挑選出log2(fold-change)＞1或＜-1、p-value＜0.01的差異表達的mRNA。然后進行功能注釋發(fā)現(xiàn)大量與細胞增殖、細胞死亡等相關(guān)的基因。
　　3.本文基于以上miRNA和mRNA差異表達分析結(jié)果，發(fā)展了一種綜合利用靶標預(yù)測及各種基因表達譜的關(guān)聯(lián)分