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1、糖基化修飾是一種蛋白質(zhì)翻譯后修飾方式,它影響蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)、定位和生物活性等。糖基化蛋白質(zhì)在植物生長(zhǎng)發(fā)育、受精識(shí)別、抗性防御等多種生物學(xué)過程中起到作用。一些研究表明植物細(xì)胞壁蛋白質(zhì)存在糖基化修飾,但植物體內(nèi)大規(guī)模糖基化蛋白質(zhì)分離與鑒定報(bào)道甚少。楊樹作為一個(gè)重要的木本模式植物,本研究開展小黑楊花芽和葉芽的糖基化蛋白質(zhì)分離與鑒定,得到的主要結(jié)果如下所述。
通過ConA-WGA-PNA-Jacalin植物凝集素親和層析,分離小黑楊雄花芽
2、、雌花芽和葉芽3種組織的糖基化蛋白質(zhì)。運(yùn)用shotgun總蛋白質(zhì)的質(zhì)譜鑒定技術(shù),鑒定分離的糖基化蛋白質(zhì),得到小黑楊雄花芽、雌花芽和葉芽糖基化蛋白質(zhì)數(shù)量分別為199、175和166個(gè)。比較雄花芽、雌花芽和葉芽被鑒定的蛋白質(zhì)信息顯示:41個(gè)蛋白質(zhì)在雄花芽、雌花芽和葉芽中均被識(shí)別,只在雄花芽、雌花芽或葉芽單一組織被識(shí)別的蛋白質(zhì)分別為75、33和47個(gè);綜合這3種組織中被分離鑒定的蛋白質(zhì),共得到255個(gè)不同的蛋白質(zhì)。
蛋白質(zhì)的功能分類
3、顯示,255個(gè)糖基化蛋白共分為10個(gè)聚類,主要參與細(xì)胞壁合成與代謝、氧化還原、蛋白質(zhì)降解、信號(hào)傳遞、脂類代謝等生物途徑。蛋白質(zhì)數(shù)量排名前4的功能聚類依次是細(xì)胞壁合成、修飾和碳水化合物代謝(33%)、氧化還原(22%)、蛋白質(zhì)降解(12%)和信號(hào)傳遞(10%)。我們分離鑒定的糖基化蛋白質(zhì)功能分類模式,類似于擬南芥細(xì)胞壁蛋白質(zhì)組的功能分類特征,這種吻合初步暗示植物細(xì)胞壁蛋白很可能需要被糖基化修飾,并且糖基化修飾可能是細(xì)胞壁蛋白正常分子功能所
4、必需的。
為了評(píng)價(jià)分離與鑒定的糖基化蛋白質(zhì),運(yùn)用相關(guān)的生物信息軟件對(duì)255個(gè)糖基化蛋白進(jìn)行N-糖基化位點(diǎn)和信號(hào)肽分析。226個(gè)糖基化蛋白存在多個(gè)N-糖基化位點(diǎn),占糖基化蛋白組89%。189個(gè)糖基化蛋白具有信號(hào)肽,占糖基化蛋白組74%。這一分析結(jié)果表明,分離與鑒定的小黑楊花芽和葉芽組織糖基化蛋白具有較高的可靠性。
蛋白質(zhì)的亞細(xì)胞定位和跨膜結(jié)構(gòu)域的分析顯示:83%糖基化蛋白涉及到分泌途徑,定位于細(xì)胞壁、細(xì)胞膜、內(nèi)質(zhì)網(wǎng)和液
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