欽州市HIV-1流行狀況及亞型分析.pdf

1、目的：流行病學(xué)與分子生物學(xué)方法相結(jié)合，了解掌握欽州市HIV-1的流行狀況及其亞型分布特征，為今后欽州乃至廣西地區(qū)的HIV-1的防控工作提供資料和依據(jù)。
　　方法：以調(diào)查問(wèn)卷的形式收集50例欽州市HIV-1感染者的人口學(xué)及流行病學(xué)資料，每例感染者采集抗凝全血5-10毫升，提取血漿病毒RNA，用逆轉(zhuǎn)錄/巢式PCR法擴(kuò)增gag區(qū)核酸片段，對(duì)PCR擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行鑒定，將陽(yáng)性擴(kuò)增產(chǎn)物送北京軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院微生物流行病研究所進(jìn)行基因測(cè)序，用Bio

2、Edit、MEGA5.03軟件、Distance程序及在線分析工具Genotyping對(duì)所測(cè)得序列進(jìn)行裁剪、校正、比對(duì)、構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)和亞型分析。
　　結(jié)果：⑴本實(shí)驗(yàn)共收集血液樣本50例，其人口學(xué)及流行病學(xué)特征如下：50例感染者的居住地包含欽州市欽南區(qū)，欽北區(qū)及下轄的浦北縣、靈山縣；感染者的男女比例為1.38∶1，小于40歲的感染者31例，漢族及壯族感染者48例；異性傳播和靜脈吸毒兩種傳播途徑所占的比例為96％。⑵50例血液樣本經(jīng)

3、血漿病毒RNA提取，逆轉(zhuǎn)錄/巢式PCR擴(kuò)增，基因測(cè)序最終獲得36條基因序列，擴(kuò)增率為72％。⑶經(jīng)美國(guó)NCBI進(jìn)行在線初步分型，及MEGA5.03軟件構(gòu)建系統(tǒng)樹(shù)進(jìn)一步驗(yàn)證，最終確定36條序列包含01_ AE、07_BC、08_BC3種重組毒株，其中01_AE亞型32例(88.90％)，07_ BC亞型2例(5.55％)，08_ BC亞型2例(5.55％)，各亞型間的基因離散率分別為8.62％，6.47％，5.73％。⑷系統(tǒng)進(jìn)化分析:32例

4、01_AE亞型重組毒株與來(lái)自泰國(guó)的參考株01_AE.TH.91.TN240.L11761聚在一起，兩者的基因離散率最小，為(9.12±1.76)％，2例07_ BC亞型重組毒株與來(lái)自中國(guó)的參考株07_BC.CN.97.97.CN001_C54.AF286226聚在一起，兩者的基因離散率最小，為(7.31±2.43)％，2例08_ BC亞型重組毒株與中國(guó)廣西的BC重組代表株08_ BC.CN.97.97.CNGX_9F.AY008717聚

5、在一起，兩者的基因離散率最小，為(6.64±2.58)％。⑸不同亞型的傳播途徑分布:在32例01_AE亞型感染者中，有30例有不安全性行為史，2例有靜脈吸毒史，在各2例07_ BC和08_BC亞型感染者中，均有不安全性行為史。
　　結(jié)論：①HIV-1已在欽州市各個(gè)區(qū)縣全面流行，男女構(gòu)成比趨于平衡，感染者以漢族及壯族為主，小于40歲的青壯年居多，以性傳播和靜脈吸毒為主要傳播途徑。②欽州市HIV-1感染者中存在01_ AE、07_BC