HIV-1亞型及其耐藥突變的分子流行病學(xué)研究.pdf

1、目的：
　　目前我國(guó)HIV感染者中流行的HIV-1亞型種類復(fù)雜、多樣，且流行分布具有明顯的時(shí)間、地點(diǎn)和人群分布差異。研究表明，HIV-1亞型與艾滋病病程及其耐藥突變具有一定的關(guān)聯(lián)。隨著我國(guó)艾滋病流行模式的轉(zhuǎn)變和抗病毒治療規(guī)模的不斷擴(kuò)大，有必要開(kāi)展系統(tǒng)全面的HIV-1亞型及其耐藥突變的分子流行病學(xué)調(diào)查，從分子水平揭示HIV-1的流行信息和流行趨勢(shì)。目前性傳播已成為我國(guó)HIV的主要傳播途徑，本研究通過(guò)Meta分析，在系統(tǒng)全面地了解我國(guó)

2、HIV經(jīng)性傳播人群中HIV-1亞型流行分布特征的基礎(chǔ)上，開(kāi)展本次的分子流行病學(xué)調(diào)查研究，以初步了解無(wú)錫市HIV-1亞型及耐藥突變的流行分布情況，并結(jié)合常規(guī)工作中關(guān)于HIV/AIDS的流調(diào)、隨訪、治療等信息，以初步探討HIV-1感染病程和耐藥的可能影響因素，旨在為該市艾滋病的防治工作提供有價(jià)值的信息。
　　方法：
　　1.Meta分析:檢索PubMed、Web of Science、CNKI、CBM、萬(wàn)方等數(shù)據(jù)庫(kù)，收集公開(kāi)發(fā)表

3、的有關(guān)中國(guó)HIV-1亞型的研究文獻(xiàn)。按納入與排除標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行文獻(xiàn)的篩選和數(shù)據(jù)提取，運(yùn)用Freeman-Tukey雙反正弦變換法對(duì)不同病毒亞型的流行率進(jìn)行合并計(jì)算，并從研究時(shí)間、研究地點(diǎn)和研究人群三個(gè)方面進(jìn)行亞組分析。Meta分析軟件包括R3.2.1和SAS9.3。
　　2.HIV-1亞型分析:以無(wú)錫市疾控中心2012～2013年常規(guī)CD4監(jiān)測(cè)隨訪隊(duì)列中的343例HIV/AIDS患者為研究對(duì)象，在知情同意的基礎(chǔ)上進(jìn)行流行病學(xué)個(gè)案調(diào)查和靜

4、脈血采集，并采用巢式PCR擴(kuò)增env和pol區(qū)的部分基因片段后送至生物公司測(cè)序，根據(jù)env和pol的部分基因序列進(jìn)行病毒亞型分析。
　　3.HIV-1耐藥突變分析:將279例研究對(duì)象的pol基因序列（覆蓋pol區(qū)的蛋白酶基因全長(zhǎng)及反轉(zhuǎn)錄酶1-280位左右的密碼子序列）提交至美國(guó)斯坦福大學(xué)HIV耐藥數(shù)據(jù)庫(kù)，進(jìn)行耐藥基因突變分析。
　　4.統(tǒng)計(jì)學(xué)分析:建立Excel數(shù)據(jù)庫(kù)，使用SAS9.3或SPSS19.0軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析。定

5、性資料采用率或構(gòu)成比描述，用x2檢驗(yàn)或Fisher確切概率法或Kruskal-Wallis法進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析，P＜0.05為差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義;定量資料采用均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差((x)±s)描述。采用重復(fù)測(cè)量資料的方差分析進(jìn)行CD4+T淋巴細(xì)胞計(jì)數(shù)變化差異的分析，采用非條件Logistic回歸或生存分析進(jìn)行HIV病程和耐藥的影響因素分析。
　　結(jié)果：
　　1.Meta分析共納入130篇文獻(xiàn)，包括18725例成功分型的樣本。CRF01

6、AE、B、CRF07_BC、CRF08 BC和C亞型的合并流行率分別為44.54％(95％CI:40.81-48.30)、18.31％(95％CI:14.71-22.17)、16.45％(95％CI:13.82-19.25)、2.55％(95％CI:1.56-3.73)、0.37％(95％CI:0.11-0.72)。分層分析發(fā)現(xiàn)，B亞型在性傳播感染人群中的流行率呈下降趨勢(shì)，而CRF01_AE、CRF07_BC在性傳播感染人群中和CRF0

7、8 BC在異性傳播感染人群中的流行率呈上升趨勢(shì)，且不同地區(qū)的HIV-1亞型分布呈現(xiàn)明顯差異。
　　2.最終有313例研究對(duì)象成功進(jìn)行HIV-1分型，其中CRF01 AE所占比例最高，達(dá)49.4％(155/313)，其他亞型及流行比例分別為CRF07_BC16.9％(53/313)、B12.8％(40/313)、CRF08_ BC9.3％(29/313)、CRF67_01B3.8％(12/313)、CRF68_01B1.9％(6/3

8、13)、CRF02_ AG0.3％(1/313)、CRF59_01B0.3％(1/313)、C0.3％(1/313)和URFs4.8％(15/313)，不同性別、年齡和傳播途徑間的病毒亞型分布存在統(tǒng)計(jì)學(xué)差異（P＜0.01）。
　　3.279例研究對(duì)象中，共發(fā)現(xiàn)36例存在耐藥基因突變，耐藥率為5.0％(14/279)，其中未用藥人群的耐藥率為1.8％(4/220)，用藥人群的耐藥率為16.9％(10/59)，二者存在統(tǒng)計(jì)學(xué)差異。耐藥

9、突變主要包括D30N、L90M、K65R、M184IV、K103N和Y181C等點(diǎn)突變所引起的不同類型抗病毒藥物的高度或中度耐藥，而其他耐藥突變則引起低度或潛在低度耐藥。
　　4.病程的影響因素分析發(fā)現(xiàn)，HIV-1 CRF07/08_BC毒株感染相對(duì)B亞型，病程進(jìn)展緩慢(OR=0.312，95％CI:0.134～0.728)，然而CRF07/08_ BC毒株感染者合并耐藥突變較B亞型毒株感染者合并耐藥突變的病程進(jìn)展更快(OR=12

10、.276，95％CI:2.255～66.830);耐藥的影響因素分析發(fā)現(xiàn)，HIV確診時(shí)年齡是產(chǎn)生耐藥的保護(hù)因素(OR=0.930，95％CI:0.909～0.987)，即HIV確診時(shí)年齡越小越易發(fā)生耐藥。
　　結(jié)論：
　　1.中國(guó)HIV-1經(jīng)性傳播人群的亞型分布存在較大的時(shí)間變異性和地理差異性，HIV-1的高度變異性給艾滋病的監(jiān)測(cè)、預(yù)防和控制帶來(lái)了極大挑戰(zhàn)。
　　2.目前無(wú)錫市流行的HIV-1毒株種類復(fù)雜多樣，為有效控

11、制新的重組毒株的產(chǎn)生與流行，應(yīng)進(jìn)一步加強(qiáng)不同高危人群的健康教育和行為干預(yù)，并嚴(yán)密監(jiān)測(cè)HIV-1亞型的流行動(dòng)態(tài)。
　　3.相對(duì)B亞型，non-B亞型中的CRF07/08_BC感染后病程進(jìn)展緩慢，然而CRF07/08_BC感染合并耐藥突變較B亞型感染合并耐藥突變的病程進(jìn)展更快，其作用機(jī)制需給予進(jìn)一步的探討。
　　4.該地區(qū)HIV-1耐藥株的傳播尚處于低流行態(tài)勢(shì)，耐藥突變主要由已有抗病毒藥物的使用所誘發(fā)，然而藥物間的交叉耐藥及耐藥