豬六個(gè)功能基因變異的分析及其對(duì)繁殖性狀的影響.pdf

1、豬的繁殖性狀是非常重要的經(jīng)濟(jì)性狀,母豬產(chǎn)仔性能和公豬生殖力的高低直接影響我國(guó)養(yǎng)豬業(yè)的經(jīng)濟(jì)和生產(chǎn)效益。根據(jù)國(guó)內(nèi)外報(bào)道豬-人比較圖譜和基因生理生化功能,分別選取了影響豬胚胎早期發(fā)育、著床的四個(gè)候選基因合子阻滯因子1(ZAR1)、胰島素樣生長(zhǎng)因子2受體(IGF-IIR)、白血病抑制因子(LIF)、同源框A基因簇11(HOXA11)和影響公豬精子發(fā)生和生殖力的兩個(gè)候選基因Y染色體特異泛蛋白激酶9(USP9Y)、雄激素受體(AR),采用生物信息學(xué)

2、、PCR-SSCP、測(cè)序及PCR-RFLP的方法進(jìn)行SNP位點(diǎn)的篩選,以小梅山、清平、杜洛克、長(zhǎng)白、大白豬為材料,研究了這些基因的多態(tài)性與繁殖性狀的相關(guān)性,具體結(jié)果如下:
　　 1.在不同品種豬ZAR1基因中檢測(cè)到14個(gè)突變位點(diǎn),并對(duì)外顯子3第54處C/T替換的SNP引起的BstUⅠ酶切多態(tài)性、內(nèi)含子3第1270處C/A替換的SNP引起的AIUⅠ酶切多態(tài)性和內(nèi)含子3第1186處5個(gè)堿基(TGCAG)插入/缺失引起的TspRⅠ酶切

3、多態(tài)性,并分別建立了3個(gè)位點(diǎn)的PCR-BstUⅠ-RFLP、PCR-AIUⅠ-RFLP租PCR-TspRⅠ-RFLP基因分型方法。
　　 2.在不同品種豬LIF基因檢測(cè)到1個(gè)SNP,對(duì)外顯子3第93處G/A替換的SNP引起的TspRⅠ酶切多態(tài)性,建立了該位點(diǎn)PCR-TspRⅠ-RFLP基因分型方法；在不同品種豬HOXA11基因檢測(cè)到3個(gè)SNPs,對(duì)外顯子2第218處A/G替換的SNP引起的BsRⅠ酶切多態(tài)性,建立了該位點(diǎn)PCR-

4、BsRⅠ-RFLP基因分型方法。
　　 3.在不同品種豬USP9Y基因檢測(cè)到1個(gè)多態(tài)性位點(diǎn),并建立了該基因36外顯子多態(tài)性位點(diǎn)PCR-SSCP分型方法。
　　 4.在不同品種豬IGF-IIR和AR基因中未檢測(cè)到突變。
　　 5.3個(gè)基因5個(gè)位點(diǎn)基因型頻率和等位基因頻率在5個(gè)不同豬品種中的分布特征。對(duì)ZAR1基因BstUⅠ-RFLP、AIUⅠ-RFLP和TspRⅠ-RFLP3位點(diǎn)基因型頻率和等位基因頻率進(jìn)行了分析,

5、BstUⅠ-RFLP位點(diǎn)僅在中國(guó)小梅山和清平豬中發(fā)現(xiàn)了CC基因型,在杜洛克、長(zhǎng)白和大白豬中均存在3種基因型；AIUⅠ-RFLP和TspRⅠ-RFLP位點(diǎn)在5個(gè)品種豬群中均存在3種基因型。
　　 在5個(gè)不同品種豬群檢測(cè)了LIF基因TspRⅠ-RFLP基因型頻率和等位基因頻率分布,均未檢測(cè)到AA基因型的存在。
　　 在5個(gè)不同品種豬群檢測(cè)了HOXA11基因BsRⅠ-RFLP位點(diǎn)基因型頻率和等位基因頻率分布,結(jié)果發(fā)現(xiàn)均存在3種

6、基因型。
　　 6.ZAR1基因BstUⅠ-RFLP標(biāo)記與繁殖性狀關(guān)聯(lián)分析,在杜洛克母豬中該位點(diǎn)對(duì)第1、2胎總產(chǎn)仔數(shù)影響顯著(P<0.05),對(duì)經(jīng)產(chǎn)胎次的總產(chǎn)仔數(shù)和產(chǎn)活仔數(shù)影響極顯著(P<0.01),攜帶CC基因型母豬每胎平均總產(chǎn)仔數(shù)和產(chǎn)活仔數(shù)比TT基因型的高2.32頭和1.87頭,推測(cè)C等位基因可能為有利等位基因。
　　 ZAR1基因TspRⅠ-RFLP不同基因型與繁殖性狀的相關(guān)性分析,該位點(diǎn)變異對(duì)杜洛克母豬頭胎的總產(chǎn)

7、仔數(shù)和產(chǎn)活仔數(shù)影響極顯著(P<0.01),對(duì)經(jīng)產(chǎn)胎次的總產(chǎn)仔數(shù)和產(chǎn)活仔數(shù)也有顯著影響(P<0.05),經(jīng)產(chǎn)胎次的總產(chǎn)仔數(shù)和產(chǎn)活仔數(shù)存在NN>>MM>MN的趨勢(shì)；ZAR1基因AIUⅠ-RFLP不同基因型與繁殖性狀的相關(guān)性分析,結(jié)果表明對(duì)產(chǎn)仔數(shù)影響不顯著。
　　 7.HOXA11基因BsRⅠ-RFLP不同基因型與繁殖性狀的相關(guān)性分析,結(jié)果表明該位點(diǎn)對(duì)杜洛克和長(zhǎng)白豬頭胎的總產(chǎn)仔數(shù)顯著相關(guān)(P<0.05),對(duì)長(zhǎng)白豬經(jīng)產(chǎn)胎次的總產(chǎn)仔數(shù)顯著

8、相關(guān)(P<0.05)。
　　 LIF基因TspRⅠ-RFLP不同基因型與繁殖性狀的相關(guān)性分析,結(jié)果表明對(duì)5個(gè)品種豬的總產(chǎn)仔數(shù)和產(chǎn)活仔數(shù)影響不顯著。
　　 8.在3個(gè)品種公豬(杜洛克、長(zhǎng)白和大白)檢測(cè)了與公豬精子產(chǎn)生相關(guān)的USP9Y基因36外顯子多態(tài)性位點(diǎn)PCR-SSCP不同基因型頻率和等位基因頻率分布,均存在3種基因型；不同基因型與公豬精液品質(zhì)(5個(gè)性狀)和與配母豬平均產(chǎn)仔數(shù)關(guān)聯(lián)分析,該位點(diǎn)對(duì)公豬射精重量影響顯著(P<0