天然蛋白酶體抑制劑的虛擬篩選研究.pdf

1、第一部分天然蛋白酶體抑制劑的虛擬篩選
　　目的：通過(guò)模擬硼替佐米與20S蛋白酶體的結(jié)合證明用分子對(duì)接的方法進(jìn)行PI虛擬篩選的可行性,并進(jìn)一步從天然小分子結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)中篩選出潛在的蛋白酶體抑制劑。
　　方法：采用分子對(duì)接的方法進(jìn)行虛擬篩選可行性研究,用藥效團(tuán)模型方法,分子對(duì)接方法,原型分子形狀相似性等方法組成梯度多步驟篩選策略進(jìn)行數(shù)據(jù)庫(kù)搜索篩選可能的蛋白酶體抑制劑。
　　結(jié)果：分子對(duì)接模擬中硼替佐米能夠與20S蛋白酶體活性

2、部位較好結(jié)合,結(jié)合模式與晶體結(jié)構(gòu)中相關(guān)模式高度吻合,已知蛋白酶體抑制劑均能夠與蛋白酶體較好結(jié)合,且預(yù)測(cè)活性與實(shí)際活性呈線性相關(guān),模擬還顯示沒(méi)有蛋白酶體抑制活性的化合物不能與蛋白酶體穩(wěn)定結(jié)合;篩選出了五十余具有潛在蛋白酶體抑制劑活性的化合物,其中包含已知的姜黃素和茶多酚及雷公藤紅素等,文獻(xiàn)也顯示這些化合物多數(shù)具備抗炎抗病毒或者抗腫瘤活性,其中多種分子還具有明確抗白血病作用。
　　結(jié)論：虛擬篩選方法可以用于蛋白酶體抑制劑的虛擬篩選,篩

3、選出的多種化合物具有潛在蛋白酶體抑制劑活性
　　第二部分蛋白酶體抑制劑篩選結(jié)果的實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證
　　目的：測(cè)定篩選出的化合物是否具備蛋白酶體抑制活性及大體測(cè)定其半抑制濃度的圍,進(jìn)一步證明虛擬篩選方法用于蛋白酶體抑制劑篩選的可行性。
　　方法：熒光標(biāo)記法測(cè)定天然化合物對(duì)蛋白酶體的抑制作用。蛋白酶體分解熒光底物,釋放熒光物質(zhì),通過(guò)對(duì)熒光強(qiáng)度的檢測(cè)反映抑制強(qiáng)度的高低,并估算出其大概的IC50范圍.
　　結(jié)果：10種化合物可以