白樺雌雄花序轉(zhuǎn)錄組分析及SEP1基因的功能鑒定.pdf

1、白樺(Betual platyphylla)是中國北方經(jīng)濟(jì)價值較高的樹種，目前關(guān)于它的研究已經(jīng)取得了很好的進(jìn)展，但對于其開花發(fā)育機(jī)理還不是很深入。為了更多的了解白樺花期基因表達(dá)背景，本研究利用新一代高通量Solexa測序技術(shù)對白樺雌雄花序進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序，通過生物信息學(xué)分析發(fā)掘與花發(fā)育性狀相關(guān)的候選基因，為后續(xù)開展功能基因研究和分子育種實踐提供有價值信息;利用RACE和qRT-PCR技術(shù)，對白樺SEP1進(jìn)行基因克隆和表達(dá)分析，并通過轉(zhuǎn)基因

2、擬南芥研究它的生物學(xué)功能。主要結(jié)果和結(jié)論如下:(1)白樺花序轉(zhuǎn)錄組測序的數(shù)據(jù)產(chǎn)量堿基數(shù)約合4.3 G，總共進(jìn)行了25，027，337次讀數(shù)，總共產(chǎn)生107，102條Unigenes，其中雌花序49，516條，雄花序57，586條，長度在1kb以上Unigenes有32，706條，占Unigenes庫總數(shù)的30.5％。(2)基于RPKM法，在雌雄花序轉(zhuǎn)錄組中得到2671條差異表達(dá)的Unigenes，其中有GO注釋的1985條，COG注釋的