草魚恒定鏈基因的克隆、分子特征及其與MHC分子關系的研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、恒定鏈(invariant chain,Ii)是一種非多態(tài)性II型跨膜糖蛋白,編碼的白細胞分化抗原為CD74,存在于多種細胞表面上。Ii鏈是MHC II類分子的重要伴侶蛋白,在內質網(wǎng)中輔助MHC II類分子進行正確的折疊、組裝并與MHC II類分子聚合成(αβIi)3九聚體以及靶向內體的轉運,同時Ii鏈以其CLIP區(qū)(the class-IIassociated Ii chain peptide)占據(jù)MHC II類分子的抗原結合槽,從而

2、阻止內源性抗原肽與MHC II類分子結合。 Ii鏈在MHC II類分子呈遞外源性抗原給CD4+T淋巴細胞的過程中起著關鍵性作用,對于機體的免疫應答具有重要調節(jié)意義。目前基于Ii的核酸疫苗已得到相關應用。
  前,對于Ii鏈結構與功能的研究主要集中在人等哺乳動物以及禽類,而對魚類了解甚少。魚類處于生物鏈的底端。為研究魚類Ii鏈的結構與功能,本實驗首次獲得了草魚Ii鏈的基因序列,并對其生物信息學分析和結構建模,同時對草魚Ii與MHC在

3、不同組織中的定量表達關系和細胞定位表達進行了研究,最后制備了草魚恒定鏈的特異性抗體,為進一步研究魚恒定鏈的結構功能、進化關系以及與主要組織相容性復合體的關系提供理論基礎。
  第一,本實驗應用RT-PCR和RACE法成功克隆了草魚魚Ii基因,經(jīng)測序和比對鑒定該草魚Ii的全長大小為1116bp,編碼區(qū)的大小是711bp,含有236個氨基酸。
  第二,利用生物信息學方法將草魚Ii鏈與其他物種的Ii鏈進行比對,發(fā)現(xiàn)草魚Ii鏈也包

4、括胞漿區(qū)、跨膜區(qū)、內質網(wǎng)腔區(qū)和甲狀蛋白(Tg)4個結構域。根據(jù)推測的氨基酸序列,進行不同種間Ii鏈的同源性進化關系分析,發(fā)現(xiàn)草魚與鰱魚的親緣關系最近。應用生物學相關軟件,將草魚Ii鏈與其他物種比較,構建3D結構模型,結果發(fā)現(xiàn)草魚與人、小鼠、雞、鵝和斑馬魚的Ii鏈在空間結構上十分相似,甚至在一些位點上的氨基酸都是相同的。
  第三,以18sRNA基因為內參基因,運用相對熒光定量的方法檢測Ii與MHC在草魚十二種不同組織中的表達關系,

5、結果表明草魚Ii與MHC在組織中的表達呈正相關,同時還將Ii與MHC分別插入真核表達質粒Pmcherry-C1和pEGFP-N1,轉染293T細胞,結果顯示它們分別定位于內膜系統(tǒng)。
  最后,原核表達草魚Ii,以純化的蛋白免疫小鼠制備了抗草魚Ii的多克隆抗體,并通過Western Blot驗證了抗體的特異性,為研究Ii與MHC的相互作用提供一定基礎。
  上述實驗表明,作為重要免疫分子的Ii鏈,不僅在遺傳背景上而且在空間的結

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