基于水稻產(chǎn)量基因GS3的玉米同源序列的克隆與分析.pdf

1、農(nóng)作物的產(chǎn)量一直是人們最重視的農(nóng)藝性狀之一。目前，利用分子標(biāo)記技術(shù)已經(jīng)定位了多個(gè)農(nóng)作物產(chǎn)量以及產(chǎn)量相關(guān)組分的QTL(quantitative trait loci)。但是，產(chǎn)量性狀屬于數(shù)量性狀，直接進(jìn)行圖位克隆比較困難。最近，比較基因組學(xué)的發(fā)展為QTL的比較克隆提供了新的途徑。本研究目的就是利用模式生物一水稻的基因組信息進(jìn)行玉米中QTL的比較克隆，并試圖通過該基因的克隆為解析玉米產(chǎn)量QTL的生物學(xué)基礎(chǔ)提供有益信息。 本實(shí)驗(yàn)以玉米

2、白交系Z3、871以及由其組配的192個(gè)重組自交系為材料，根據(jù)水稻第三條染色體上一個(gè)控制粒重、粒長(zhǎng)、粒寬、粒厚的QTL(圖位克隆后命名為GS3)所在BAC信息，利用生物信息學(xué)比對(duì)、標(biāo)記定位方法確定了與水稻GS3區(qū)域同源的玉米區(qū)段，利用水稻GS3在玉米中的同源序列獲取了玉米中GS3的部分基因組序列，并依據(jù)玉米GS3的序列信息在玉米自交系和大芻草中找出了GS3的序列差異。具體實(shí)驗(yàn)結(jié)果如下： 1、從水稻數(shù)據(jù)庫(kù)下載了GS3上下游的18個(gè)

3、基因的序列，其中9個(gè)可以在玉米中找到同源的EST/GSS序列，將這9個(gè)基因定位丁Z3、871的RIL群體中，發(fā)現(xiàn)其中5個(gè)定位于chr．1bnlg1811-umc2112，另外4個(gè)分布于其他染色體上。說明玉米第一染色體bnlg1811-umc2112與水稻GS3所在區(qū)域直系同源，其中3個(gè)基因的定位結(jié)果在B73/BY804的RIL群體中得到驗(yàn)證。 2、根據(jù)水稻GS3在玉米中同源的GSS序列，用TAIL-PCR對(duì)其進(jìn)行了雙向延伸，延伸