基于水稻產量基因GS3的玉米同源序列的克隆與分析.pdf

1、農作物的產量一直是人們最重視的農藝性狀之一。目前，利用分子標記技術已經定位了多個農作物產量以及產量相關組分的QTL(quantitative trait loci)。但是，產量性狀屬于數量性狀，直接進行圖位克隆比較困難。最近，比較基因組學的發(fā)展為QTL的比較克隆提供了新的途徑。本研究目的就是利用模式生物一水稻的基因組信息進行玉米中QTL的比較克隆，并試圖通過該基因的克隆為解析玉米產量QTL的生物學基礎提供有益信息。 本實驗以玉米

2、白交系Z3、871以及由其組配的192個重組自交系為材料，根據水稻第三條染色體上一個控制粒重、粒長、粒寬、粒厚的QTL(圖位克隆后命名為GS3)所在BAC信息，利用生物信息學比對、標記定位方法確定了與水稻GS3區(qū)域同源的玉米區(qū)段，利用水稻GS3在玉米中的同源序列獲取了玉米中GS3的部分基因組序列，并依據玉米GS3的序列信息在玉米自交系和大芻草中找出了GS3的序列差異。具體實驗結果如下： 1、從水稻數據庫下載了GS3上下游的18個

3、基因的序列，其中9個可以在玉米中找到同源的EST/GSS序列，將這9個基因定位丁Z3、871的RIL群體中，發(fā)現其中5個定位于chr．1bnlg1811-umc2112，另外4個分布于其他染色體上。說明玉米第一染色體bnlg1811-umc2112與水稻GS3所在區(qū)域直系同源，其中3個基因的定位結果在B73/BY804的RIL群體中得到驗證。 2、根據水稻GS3在玉米中同源的GSS序列，用TAIL-PCR對其進行了雙向延伸，延伸