組合藥物數(shù)據(jù)庫(kù)構(gòu)建及藥物協(xié)同作用機(jī)理分析.pdf

1、目前作為治療復(fù)雜或退行性疾病的安全、有效手段，組合藥物引起了廣泛關(guān)注。為了促進(jìn)這方面的研究和新組合藥物的發(fā)現(xiàn)，通過(guò)收集整理已知的組合藥物應(yīng)用例子，建成了組合藥物數(shù)據(jù)庫(kù)。此數(shù)據(jù)庫(kù)的長(zhǎng)遠(yuǎn)目標(biāo)是通過(guò)分析這些己知的組合藥物例子，得到一些組合藥物協(xié)同相互作用模式，為進(jìn)一步的理論建模和體外模擬提供基礎(chǔ)。
　　 在本數(shù)據(jù)庫(kù)中，組合藥物是經(jīng)過(guò)嚴(yán)格試驗(yàn)測(cè)試的，具有明確適應(yīng)癥和劑量關(guān)系的藥物組合。組合使用的目標(biāo)有以下幾個(gè)方面：為了得到更好的療效，降

2、低不必要的毒副作用，減少或降低抗藥性產(chǎn)生的幾率，或者在增加療效的同時(shí)減低副作用(在療效上取得協(xié)同效果，在副作用上得到拮抗效果)。
　　 組合藥物數(shù)據(jù)的來(lái)源主要有：FDA的橙皮書、已發(fā)表的研究文獻(xiàn)和美國(guó)臨床試驗(yàn)網(wǎng)站數(shù)據(jù)。目前版本的數(shù)據(jù)庫(kù)中，有178個(gè)組合藥物數(shù)據(jù)來(lái)自于橙皮書，另外的321個(gè)處于不同的研發(fā)階段的組合藥物分別來(lái)自于文獻(xiàn)和臨床試驗(yàn)報(bào)告，其中包含了40不成功的組合藥物例子。對(duì)于組合藥物涉及的每一個(gè)單藥物組分，數(shù)據(jù)庫(kù)從Dru

3、gbank、PubChem和PubMed文獻(xiàn)中，收集了它的藥理、化學(xué)、結(jié)構(gòu)和作用機(jī)制等信息。同時(shí)將單藥物相關(guān)的代謝酶和靶標(biāo)信息收錄其中，信息包含：蛋白質(zhì)序列、在細(xì)胞中的位置和功能注釋信息，還有具體的三維結(jié)構(gòu)等，又從PID、BioCarta和Reactome中得到靶標(biāo)所對(duì)應(yīng)的生物通路信息。
　　 組合藥物應(yīng)用的療效信息來(lái)自于FDA的批準(zhǔn)文件和報(bào)道此例子的文獻(xiàn)?；诮M合藥物是否達(dá)到預(yù)期療效，或相對(duì)同類藥物是否有所改進(jìn)，組合藥物應(yīng)用的

4、療效被歸入以下兩類：有效的和無(wú)效的。同時(shí)根據(jù)總體療效和單藥療效的關(guān)系，即總體療效是大于、等于或小于單藥物加和效果，每一類又可具體分為：協(xié)同效應(yīng)、加和效應(yīng)或拮抗效應(yīng)。
　　 一個(gè)組合藥物中包含的單藥物成分之間的相互作用，決定了組合藥物的總體療效，這些藥物之間的相互關(guān)系，根據(jù)它們?cè)谒幬镏委熯^(guò)程中發(fā)生作用位置的不同，將藥物相互作用分為兩個(gè)層次。第一層有兩個(gè)類別：藥物代謝動(dòng)力學(xué)相互作用和藥效動(dòng)力學(xué)相互作用，代謝動(dòng)力學(xué)相互作用是指一個(gè)藥物

5、影響了另一個(gè)的吸收、分布、代謝和排除過(guò)程，而藥效動(dòng)力學(xué)相互作用是指一個(gè)藥物影響了另一個(gè)藥效作用過(guò)程，具體體現(xiàn)在藥物作用位點(diǎn)的關(guān)系上。接下來(lái)在第二個(gè)層次中，依據(jù)藥物間發(fā)生影響的代謝過(guò)程，代謝動(dòng)力學(xué)相互作用又可具體分為以下幾個(gè)子類：增強(qiáng)或降低藥物的轉(zhuǎn)運(yùn)或過(guò)膜，加強(qiáng)或減弱藥物的分布或降低血漿水平，影響藥物的分解代謝速度，加快或減慢藥物的排出。根據(jù)藥物作用的靶標(biāo)間的關(guān)系，藥效動(dòng)力學(xué)相互作用可以繼續(xù)分為：作用于同一個(gè)靶標(biāo)，作用于同一個(gè)調(diào)控通路的不

6、同靶標(biāo)，作用于兩條相互聯(lián)系通路的不同靶標(biāo)，作用于關(guān)系不明的兩條通路的不同靶標(biāo)四個(gè)子類別。通過(guò)藥物間的相互作用類型，來(lái)進(jìn)一步解釋組合藥物機(jī)理。
　　 目前版本的組合藥物數(shù)據(jù)庫(kù)(http：//www.cls.zju.edu.cn/dcdb/)中共收錄了499個(gè)組合藥物數(shù)據(jù)和其517個(gè)具體應(yīng)用，涉及485個(gè)單藥物，6000多篇文獻(xiàn)。針對(duì)每個(gè)組合藥物數(shù)據(jù)庫(kù)提供了總體藥效、適應(yīng)癥、可能的相互作用機(jī)理和目前的研究狀況信息。對(duì)于單藥物提供了化

7、學(xué)、藥理學(xué)和結(jié)構(gòu)信息，同時(shí)還有相關(guān)的作用靶標(biāo)和代謝酶，靶標(biāo)所在信號(hào)通路等信息，為了方便研究者使用還提供了到很多相關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)的鏈接。
　　 通過(guò)對(duì)組合藥物作用機(jī)理進(jìn)行歸納分析，一些初步的藥物組合規(guī)律被發(fā)現(xiàn)，但這些規(guī)律還需進(jìn)一步深入研究。
　　 隨著目前科研機(jī)構(gòu)和醫(yī)藥公司對(duì)組合藥物的持續(xù)關(guān)注，組合藥物數(shù)據(jù)會(huì)持續(xù)增長(zhǎng)。未來(lái)的組合藥物數(shù)據(jù)庫(kù)不但要在存儲(chǔ)例子的數(shù)量上有所增加，還需要升級(jí)數(shù)據(jù)庫(kù)的數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)和收錄的信息種類，以提高數(shù)據(jù)庫(kù)的