中國漢族人群SLC6A11和APOE基因多態(tài)性與耐藥性癲癇的相關(guān)性研究.pdf

1、研究背景:癲癇是最常見而且嚴(yán)重的慢性神經(jīng)系統(tǒng)疾病之一，目前主要的治療手段是服用抗癲癇藥物。盡管近年來新的抗癲癇藥物在癲癇治療方面已取得長足的進(jìn)步，但迄今仍有大約30％的癲癇患者對抗癲癇藥物耐藥。耐藥性癲癇已經(jīng)成為危害公共健康的一個主要疾病，研究表明耐藥性癲癇的死亡率比一般的癲癇患者高4～7倍。
　　GABA是中樞神經(jīng)系統(tǒng)中最主要的抑制性神經(jīng)遞質(zhì)，在神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的興奮性調(diào)節(jié)中起關(guān)鍵作用，與癲癇的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān)。GABA轉(zhuǎn)運(yùn)體(GAT)

2、是一種主要存在于神經(jīng)元和神經(jīng)膠質(zhì)細(xì)胞膜上的糖蛋白，參與GABA在中樞神經(jīng)系統(tǒng)的轉(zhuǎn)運(yùn)與釋放過程。一項(xiàng)在韓國人群中的研究發(fā)現(xiàn)，編碼GAT3的SLC6A11基因與癲癇耐藥性之間存在關(guān)聯(lián)性。而在中國漢族人群中SLC6A11基因與癲癇耐藥性之間的關(guān)系尚無相關(guān)研究報(bào)道。載脂蛋白E(APOE)是中樞神經(jīng)系統(tǒng)中重要的脂質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)分子，在神經(jīng)組織的損傷修復(fù)、軸索生長和突觸形成中起重要作用。有研究表明APOE基因多態(tài)性與顳葉耐藥癲癇有關(guān)，而APOE基因多態(tài)性是

3、否與所有不同類型的耐藥性癲癇相關(guān)尚不明確。因此針對中國漢族人群SLC6A11和APOE基因多態(tài)性與耐藥性癲癇相關(guān)性的研究十分有必要。
　　研究目的:分析編碼GAT3的SLC6A11基因和編碼載脂蛋白E的APOE基因的tagSNP的分型數(shù)據(jù)，探索中國漢族人群SLC6A11和APOE基因多態(tài)性與耐藥性癲癇的相關(guān)性。
　　研究方法:本研究采用基于人群的病例——對照研究設(shè)計(jì)。
　　1、根據(jù)入選標(biāo)準(zhǔn)和排除標(biāo)準(zhǔn)收集2010年8月至

4、2012年10月期間在湘雅醫(yī)院門診的480例癲癇患者（207例耐藥組，273例敏感組）。
　　2、酚氯仿法提取全血DNA。
　　3、從國際人類基因組單體型圖計(jì)劃數(shù)據(jù)庫在SLC6A11基因和APOE基因相應(yīng)區(qū)段選取16個tagSNP。對研究對象應(yīng)用IlluminaGolden Gate定制芯片(X48-384)對所選的tagSNP進(jìn)行基因型鑒定。
　　4、擬和優(yōu)度X2檢驗(yàn)(Goodness-of-fit Chi-squa

5、re test)分析對照組基因型頻率的分布是否符合H-W平衡。
　　5、分析單位點(diǎn)基因型頻率的關(guān)聯(lián)，評估單位點(diǎn)與耐藥性癲癇的相關(guān)性。
　　6、分析單體型的關(guān)聯(lián)，評估單體型與耐藥性癲癇發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)的相關(guān)性。
　　研究結(jié)果:本研究共檢測了SLC6A11基因的14個tagSNP位點(diǎn)和APOE基因的2個tagSNP位點(diǎn)，其中SLC6A11基因的1個位點(diǎn)因染色體結(jié)構(gòu)性變異導(dǎo)致聚類不好不適于本基因芯片檢測方法。
　　1、我們所研

6、究的15個位點(diǎn)多態(tài)分布在癲癇患者人群中均符合Hardy-Weinberg平衡。
　　2、敏感組與耐藥組之間SLC6A11基因13個SNP位點(diǎn)的基因型頻率無顯著性差異(P＞0.05)，SLC6A11基因rs2304725和rs1881354之間存在強(qiáng)連鎖，未發(fā)現(xiàn)具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義的單倍型。
　　3、敏感組與耐藥組之間APOE基因2個SNP位點(diǎn)的基因型頻率無顯著性差異(P＞0.05)。
　　結(jié)論:
　　1、SLC6A11