Bardet-Biedl綜合征和Usher綜合征家系的基因診斷.pdf

1、第一部分運(yùn)用高通量目標(biāo)區(qū)域捕獲測(cè)序方法對(duì)Bardet-Biedl綜合征家系進(jìn)行基因診斷
　　目的:為進(jìn)一步探索高通量、臨床可應(yīng)用的Bardet-Biedl綜合征(Bardet-BiedlSyndrome，BBS)基因診斷策略，本研究嘗試運(yùn)用高通量目標(biāo)區(qū)域捕獲測(cè)序方法對(duì)BBS家系進(jìn)行基因診斷。
　　方法:采集登記5個(gè)典型的BBS家系病例。運(yùn)用包含144個(gè)遺傳性視網(wǎng)膜變性疾病(IRD)相關(guān)基因的捕獲芯片對(duì)先證者基因組DNA進(jìn)行高

2、通量目標(biāo)區(qū)域捕獲測(cè)序。通過多種生物信息學(xué)方法分析、濾過測(cè)序數(shù)據(jù);對(duì)候選基因突變進(jìn)行直接測(cè)序及家族內(nèi)共分離實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證。
　　結(jié)果:運(yùn)用高通量目標(biāo)區(qū)域捕獲測(cè)序方法成功篩查出5個(gè)BBS家系致病基因。這些致病突變分別是WZ036家系(BBS2: I188fs200X，I188fs200X)，WZ039家系(BBS2: R480X，R480X)，WZ200家系(MKKS: C499Y，C499Y)，F(xiàn)J042家系(ARL6:R122X,R12

3、2X),RP467家系(MKS1: Y461C,R534Q)。BBS2(I188fs200X),BBS2(R480X)，MKKS(C499Y)，MKS1(Y461C，R534Q)基因突變位點(diǎn)是第一次報(bào)道。此外，WZ039家系中先證者WZ039-Ⅱ∶3被發(fā)現(xiàn)同時(shí)攜帶了純合BBS2基因無義突變(R480X)和兩個(gè)雜合BBS9基因變異(D656N，R784C)。
　　結(jié)論:本研究成功運(yùn)用高通量目標(biāo)區(qū)域捕獲測(cè)序方法對(duì)BBS家系進(jìn)行了基因診

4、斷，發(fā)現(xiàn)了新的致病基因突變位點(diǎn)，同時(shí)為BBS提供了一種高通量、可靠的基因診斷新策略。
　　第二部分運(yùn)用高通量目標(biāo)區(qū)域捕獲測(cè)序方法對(duì)Usher綜合征家系進(jìn)行基因診斷
　　目的:研究高通量目標(biāo)區(qū)域捕獲測(cè)序方法對(duì)Usher綜合征(Usher Syndrome，USH)基因診斷的可行性，為臨床USH的基因診斷探索一種高通量、可靠的新策略。
　　方法:登記5個(gè)非近親婚配的USH家系，其中2個(gè)家系存在兩代間連續(xù)發(fā)病。采集8位患者和

5、12位健康家屬的血樣標(biāo)本。設(shè)計(jì)包含144個(gè)遺傳性視網(wǎng)膜變性疾病相關(guān)基因的捕獲芯片，將先證者基因組DNA進(jìn)行高通量目標(biāo)區(qū)域捕獲測(cè)序。運(yùn)用多種生物信息學(xué)方法分析、濾過測(cè)序數(shù)據(jù)確定候選基因，通過直接測(cè)序、家系內(nèi)共分離實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證結(jié)果。
　　結(jié)果:運(yùn)用高通量目標(biāo)區(qū)域捕獲測(cè)序成功地篩查出5個(gè)USH家系USH2A基因突變，分別為F1(R3484X, Q3157X), F2(G1861S, R5143C,c.8602delA), F3(S180P,

6、IVS48+1G＞A), F4(D2738N, P1843L), F5(c.4383delT,c.4383delT)。11個(gè)USH2A基因突變位點(diǎn)被發(fā)現(xiàn)，其中G1861S、R5143C、c.8602delA、IVS48+1G＞A、D2738N、P1843L、c.4383delT是第一次報(bào)道。2個(gè)兩代間連續(xù)患病的家系被診斷出是一種假顯性遺傳。一個(gè)先證者被發(fā)現(xiàn)攜帶了3個(gè)USH2A基因突變，其中兩個(gè)突變位于同一染色體上。
　　結(jié)論:本研