結直腸癌發(fā)生相關候選基因的篩選及其在淋巴轉移中的作用研究.pdf

1、[目的]：
　　1.檢測結直腸癌病人標本中染色體位點上特異性腫瘤淋巴轉移相關候選基因SNPs以及CNVs，并分析其與結直腸癌淋巴轉移等相關臨床參數(shù)的關系。
　　2.檢測4號染色體上特異性腫瘤相關候選基因(VEGFC、CCNA2、IL2、ABCG2、EGF、NFKB1)mRNA表達量，并分析其在結直腸癌病人淋巴轉移等相關病理參數(shù)中的作用。
　　3.篩選出特異性結直腸癌淋巴轉移的腫瘤基因標志物，為結直腸癌病人淋巴轉移的臨床

2、檢測，預測預后，干預和指導治療提供科學依據(jù)。
　　[方法]：
　　1.目標區(qū)域外顯子測序捕獲25例結直腸癌病人的癌組織和癌旁正常組織的腫瘤相關基因，生物信息學和統(tǒng)計學分析與結直腸癌病人淋巴轉移相關的SNPs。
　　2.目標區(qū)域外顯子測序捕獲25例結直腸癌病人的癌組織和癌旁正常組織的腫瘤相關基因，生物信息學和統(tǒng)計學分析與結直腸癌病人淋巴轉移相關的CNVs。
　　3.RT-PCR分別檢測39例結直腸癌病人的癌組織和癌

3、旁正常組織中VEGFC、CCNA2、IL2、ABC G2、EGF、NFKB1基因的mRNA表達量;統(tǒng)計分析這6個基因的mRNA表達在癌組織和癌旁正常組織中有無差異。
　　4.RT-PCR分別檢測39例結直腸癌病人的癌組織和癌旁正常組織中VEGFC、CCNA2、IL2、ABC G2、EGF、NFKB1基因的mRNA表達量;統(tǒng)計分析這6個基因的mRNA表達量與結直腸癌病人淋巴轉移之間的關系。
　　5.RT-PCR分別檢測39例結

4、直腸癌病人的癌組織和癌旁正常組織中VEGFC、CCNA2、IL2、ABCG2、EGF、NFKB1基因的mRNA表達量;統(tǒng)計分析這6個基因的mRNA表達量與結直腸癌病人的年齡、性別、臨床分期等臨床參數(shù)之間的關系。
　　[結果]：
　　1.SLC28A3、BRCA1、RRM2、PMS2、CDA、 EPHX1、RALY、 CD33、 BCL10、ETV1基因的SNPs在淋巴轉移組中的頻率比未轉移組中的高，與結直腸癌病人的淋巴轉移呈

5、正相關性且具有統(tǒng)計學差異(P＜0.05); MST1 R、KMT2B、BCL2、LSM3、TTF1、MAP3K1基因的SNPs在淋巴轉移組中的頻率比未轉移組中的低，與結直腸癌病人的淋巴轉移呈負相關性，且具有統(tǒng)計學差異性(P＜0.05）。
　　2.DDR1、CYP21A2、SULT1 A1、XRCC2、POU5F1、FLT1基因的CNVs在淋巴轉移組和未轉移組均未見明顯差異(P＞0.05）;其中DDR1基因缺失的頻率在淋巴轉移組高于

6、未轉移組且接近有統(tǒng)計學意義(P=0.072)。
　　3.與癌旁正常組織相比，ABCG2和NFKB1基因mRNA表達量在癌組織中分別降低和升高，且差別具有統(tǒng)計學意義(P＜0.05); VEGFC、CCNA2、IL2、EGF基因mRNA表達量在癌組織和癌旁正常組織無顯著差別(P＞0.05）。
　　4.與淋巴未轉移組相比，EGF和NFKB1基因的mRNA表達量在淋巴轉移組中降低，且差別具有統(tǒng)計學意義(P＜0.05）。VEGFC、C

7、CNA2、IL2和ABCG2基因的mRNA表達量在淋巴轉移和未轉移組病人中無明顯差別(P＞0.05）。
　　5.CCNA2基因mRNA表達量在高年齡組（＞60歲）中表達量高于低年齡組（≤60歲）(P＜0.05); IL2基因表達量在遠處轉移組中顯著高于未轉移組(P＜0.05）;NFKB1基因表達量在中晚期組(Ⅲ-Ⅳ期)顯著低于早期組（Ⅰ-Ⅱ期）(P＜0.05）。VEGFC、CCNA2、IL2、ABCG2、EGF、NFKB1基因與其

8、他臨床參數(shù)未見明顯相關(P＞0.05）。
　　[結論]：
　　1.SLC28A3、BRCA1、RRM2、PMS2、CDA、EPHX1、RALY、CD33、 BCL10、ETV1、MST1 R、KMT2B、BCL2、LSM3、TTF1、MAP3K1基因的SNPs與結直腸癌的淋巴轉移相關，可以作為潛在的預測指標。為結直腸癌病人淋巴轉移的臨床檢測，預測預后，干預和指導治療提供科學依據(jù)。
　　2.ABCG2和NFKB1基因的表