PaP3基因組部分基因表達(dá)的探討.pdf

1、目的:噬菌體是寄生于細(xì)菌等微生物體內(nèi)的一類(lèi)病毒,最簡(jiǎn)單的噬菌體只有十余個(gè)基因,最復(fù)雜的噬菌體有數(shù)百個(gè)基因.展開(kāi)對(duì)噬菌體基因組學(xué)以及功能基因組學(xué)的研究,對(duì)于探討生物的多樣性,深入了解生命起源、生物進(jìn)化、遺傳變異、基因調(diào)控、生化代謝等許多重要生命現(xiàn)象有著極為重要的意義.因此,噬菌體的研究成為近年來(lái)的一個(gè)熱點(diǎn)領(lǐng)域.該研究室前期的工作已經(jīng)完成了噬菌體PaP3的全基因組測(cè)序,弄清了該噬菌體為線性雙鏈DNA,全基因組由44,249bp組成,具有24

2、7個(gè)(大于100 bp)ORFs,基因預(yù)測(cè)分析提示有69個(gè)ORFs可能是編碼基因,其中有6個(gè)ORFs分別編碼解旋酶、兩個(gè)DNA聚合酶、核酸外切酶、終止酶大亞單位和溶菌酶.除上述6個(gè)ORFs外,其余均是功能尚不清楚的新基因.這些預(yù)測(cè)是根據(jù)現(xiàn)行常用生物信息學(xué)分析軟件的分析結(jié)果.這些計(jì)算機(jī)分析結(jié)果最終還是需要實(shí)驗(yàn)證據(jù)來(lái)證實(shí).比如,在噬菌體PaP3基因組發(fā)現(xiàn)的69個(gè)ORFs中,哪些可能是真正的基因?如果是基因,它們的功能是什么?這些問(wèn)題,最終都