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文檔簡介
1、目的:E-鈣粘蛋白(CDH1)是鈣粘蛋白家族中的一個重要成員,是細胞分化、生長和細胞移動的重要調(diào)控因素,與腫瘤侵襲和轉(zhuǎn)移密切相關(guān)。該基因具有高度多態(tài)性,其啟動子區(qū)及非編碼區(qū)存在的多態(tài)性位點可通過調(diào)控基因轉(zhuǎn)錄或蛋白表達水平而影響腫瘤的發(fā)生和發(fā)展。本研究旨在探討該基因啟動子區(qū)-160C/A單核苷酸多態(tài)性(SNP)和-347G/GA SNP與中國北方人非小細胞肺癌(NSCLC)易感性和淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的關(guān)系。 方法:采用基于醫(yī)院的病例-對照
2、研究方法,收集283例NSCLC患者和285例健康對照個體的靜脈抗凝血5ml,準確記錄NSCLC患者的年齡、性別、吸煙情況、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移情況,所有患者均于放、化療前采集靜脈血標本。對照組285例為同期在本院及本市體檢中心進行健康體檢的人員,經(jīng)胸部X線,腹部B超等除外肺內(nèi)及肺外腫瘤,且無糖尿病及其他遺傳性疾病病史。準確記錄對照組個體的年齡、性別、吸煙情況。 以蛋白酶K消化-飽和氯化鈉鹽析法提取外周血白細胞DNA,采用聚合酶鏈反應(yīng)-限
3、制性片段長度多態(tài)性(PCR-RFLP)方法檢測CDH1-160C/A SNP和-347G/GA SNP各種基因型。數(shù)據(jù)統(tǒng)計分析采用SPSS13.0版軟件包進行,所有統(tǒng)計結(jié)果以P<0.05認為有統(tǒng)計學意義。經(jīng)比較各位點基因型頻率的觀察值與預(yù)期值并進行卡方檢驗行Hardy-Weinberg平衡分析。病例組與對照組的基因型分布比較采用行×列表卡方檢驗。單體型頻率及連鎖不平衡分析采用EH軟件和2LD軟件進行分析。以非條件Logistic回歸法計
4、算經(jīng)年齡、性別校正后的相對風險度的比值比(OR)及其95%可信區(qū)間(95%CI)。 結(jié)果: 1.健康對照組中的CDH1-160C/A SNP和-347G/GA SNP基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡。其中CDH1-160C/A SNP中C/C等位基因占67.7%,C/A+A/A基因型占32.3%,-347G/GA SNPs中G/G等位基因占53.0%,G/GA+GA/GA基因型占47%。 2.CDH
5、1-160C/A SNP和-347G/GA SNP基因型和等位基因型總體分布在NSCLC和健康對照組之間均無統(tǒng)計學意義。-347G/G基因型與G/GA+GA/GA基因型相比較,在NSCLC的發(fā)病風險中無統(tǒng)計學意義(OR=0.90。95%CI=0.65~1.26)。-160C/C基因型與C/A+A/A基因型相比較,在NSCLC的發(fā)病風險無統(tǒng)計學意義(OR=1.34,95%CI=0.95~1.88)。 3.NSCLC患者組的吸煙者1
6、34例(47.3%)與健康對照組118例(41.4%)相比較無統(tǒng)計學意義。 4.根據(jù)個體吸煙狀況進行分層分析發(fā)現(xiàn),CDH1-160C/A SNP中A等位基因型(C/A+A/A)的分布在不吸煙的NSCLC患者顯著高于不吸煙的健康人群。與C/C基因型相比,攜帶A等位基因可使非吸煙個體NSCLC的發(fā)病風險增加(OR=1.62,95%CI=1.02~2.57)。然而,當吸煙的NSCLC患者和吸煙的健康人群比較時,CDH1 -160C/A
7、 SNPA等位基因型(C/A+A/A)分布無統(tǒng)計學意義。在本分層分析中,CDH1 -347G/GA SNP中各等位基因型的分布,GA等位基因型(G/GA+GA/GA)與G/G基因型的發(fā)病風險無統(tǒng)計學意義。 5.根據(jù)獲得的相關(guān)淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移資料進行分層分析發(fā)現(xiàn),CDH1-160C/A SNP和-347G/GA SNP在NSCLC的有淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移組和無淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移組之間均無統(tǒng)計學意義。 6.應(yīng)用EH和2LD軟件對CDH1啟動子區(qū)-1
8、60C/A和-347G/GA SNP位點進行的聯(lián)合分析顯示,兩個多態(tài)性位點之間不存在連鎖不平衡現(xiàn)象(D=0.0019)。 結(jié)論: 1.與-160C/C基因型相比,攜帶A等位基因型(C/A+A/A)可顯著增加非吸煙人群NSCLC的發(fā)病風險。 2.CDH1-347G/GA SNP不單獨影響NSCLC的發(fā)病。 3.CDH1-160C/A SNP和-347G/GA SNP位點不存在連鎖不平衡。 4.CDH
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