

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文檔簡(jiǎn)介
1、目的:E-鈣粘蛋白(E-cadherin,CDH1)是鈣粘蛋白家族中的一個(gè)成員,與腫瘤侵襲轉(zhuǎn)移密切相關(guān)。該基因具有高度多態(tài)性,其啟動(dòng)子區(qū)及非編碼區(qū)存在的多態(tài)性位點(diǎn)可通過(guò)調(diào)控基因轉(zhuǎn)錄或蛋白表達(dá)水平而影響腫瘤的發(fā)生和發(fā)展。本研究旨在探討該基因啟動(dòng)子區(qū)-160C/A和-347G/GA單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphism,SNP)與中國(guó)北方人子宮頸鱗狀細(xì)胞癌(cervical cancer)的關(guān)系。
2、> 方法:采用基于醫(yī)院的病例.對(duì)照研究方法,收集243例腫瘤患者和323例健康對(duì)照個(gè)體的靜脈抗凝血5ml,同時(shí)記錄其病史、個(gè)人史、腫瘤家族史。以蛋白酶K消化-飽和氯化鈉鹽析法提取外周血白細(xì)胞DNA,采用聚合酶鏈反應(yīng)-限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性(polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism,PCR-RFLP)方法檢測(cè)CDH1基因的兩種多態(tài)性基因型。
3、r> 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析采用SPSS11.5版軟件包(SPSS Company,Chicago,Illinois,USA)進(jìn)行,P<0.05認(rèn)為有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。比較基因型頻率觀察值與預(yù)期值并用X2檢驗(yàn)進(jìn)行Hardy-Weinberg平衡分析。CDH1基因型及等位基因型分布在病例組與對(duì)照組中的分布比較采用行×列表X2檢驗(yàn)。單體型頻率及連鎖不平衡分析采用EH軟件和2LD軟件(1.2version,Rockefeller University,
4、New York)。以非條件Logistic回歸法計(jì)算表示相對(duì)風(fēng)險(xiǎn)度的比值比(odds ratio,OR)及95%可信區(qū)間(confidence interval,CI)(年齡作校正)。
結(jié)果:
1對(duì)照組CDH1基因-160C/A、-347G/GA兩個(gè)多態(tài)性位點(diǎn)的基因型頻率分布均符合Hardy-Weinberg平衡(P=0.80,P=0.38)。
2 CDH1基因-347G/GA多態(tài)3種基因型頻
5、率(G/G、G/GA、GA/GA)在子宮頸癌組和對(duì)照組中分別是46.5%、38.7%、14.8%和54.2%、39.3%、6.5%,兩組比較有顯著性差異(P=0.004);CDH1基因-347G/GA多態(tài)的等位基因頻率(G、GA)在子宮頸癌組和對(duì)照組中分別是65.8%、34.2%和73.8%、26.2%,子宮頸癌組的GA等位基因頻率(34.2%)明顯高于對(duì)照組(26.2%),兩組比較有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.004),與G等位基因比較,攜帶
6、GA等位基因可能增加子宮頸癌的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)(OR=2.66,95%CI=1.46~4.78)。與G/G基因型比較,攜帶GA等位基因的基因型(G/GA+GA/GA)有增加子宮頸癌的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)的趨勢(shì),OR值為1.36(95%CI=0.97~1.89)。以臨床分型分層分析發(fā)現(xiàn),攜帶GA等位基因的基因型(G/GA+GA/GA)可以明顯增加空洞型子宮頸癌的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)(OR=2.53,95%CI=1.00~6.38),以腫瘤大小分層分析發(fā)現(xiàn),攜帶GA等位基
7、因的基因型(G/GA+GA/GA)有增加腫瘤直徑>6cm子宮頸癌的趨勢(shì)(OR=1.74,95%CI=0.96~3.16),與臨床分期及療效無(wú)關(guān)。
3 CDH1基因-160C/A多態(tài)的基因型和等位基因頻率在子宮頸癌組和對(duì)照組中分布無(wú)顯著性差異(P=0.31和P=0.15)。與C/C基因型比較,C/A+A/A基因型可能與子宮頸癌的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)無(wú)關(guān)(OR=1.25,95%CI=0.89~1.76)。以臨床分期分層分析發(fā)現(xiàn),C/A+A
8、/A基因型有增加早期子宮頸癌的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)的趨勢(shì)(OR=1.45,95%CI=0.98~1.95)。以臨床分型、腫瘤大小和治療結(jié)束時(shí)療效評(píng)價(jià)分層分析,CDH1基因-160C/A多態(tài)的基因型頻率在各組間分布也均未發(fā)現(xiàn)顯著性差異(P值均大于0.05)。
4對(duì)CDH1基因-160C/A和-347G/GA兩個(gè)SNP位點(diǎn)進(jìn)行聯(lián)合分析顯示,-160C/-347G單體型是人群中最常見(jiàn)的,占59.7%,4種單體型(-160C/-347G、-1
9、60C/-347GA、-160A/-347G和-160A/-347GA)頻率在子宮頸癌組與對(duì)照組中分布有顯著性差異(P=0.01)。另外發(fā)現(xiàn),CDH1-160C等位基因和-347G等位基因存在連鎖不平衡現(xiàn)象(D’=0.79,SD=0.07)。
5 CDH1基因-347G/GA多態(tài)3種基因型頻率(G/G、G/GA、GA/GA)在子宮頸癌患者HPV16,18型感染陽(yáng)性組和陰性組中分別是44.7%、39.2%、16.1%和61.
10、5%、34.6%、3.8%,分布無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.09);與G/G基因型比較,攜帶GA等位基因的基因型(G/GA+GA/GA)與HPV16.18型感染無(wú)關(guān),OR值為1.98(95%CI=0.86~4.56)。
6 CDH1基因-160C/A多態(tài)的基因型在HPV-16、18型感染陽(yáng)性組及陰性組中分布無(wú)顯著性差異(P=0.72)。與C/C基因型比較,C/A+A/A基因型可能與HPV-16、18型感染無(wú)關(guān)(OR=0.81,9
11、5%CI=0.39~1.84)。
結(jié)論:
1 CDH1基因-160C/A的基因多態(tài)性可能與宮頸癌的易感性無(wú)關(guān)。
2 攜帶CDH1基因-347GA等位基因的基因型可能增加宮頸癌的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)。
3 CDH1基因-160C/A和-347G/GA SNPs與HPV-16、18型的感染無(wú)關(guān)。
4 CDH1基因-160C/A和-347G/GA SNP位點(diǎn)存在明顯的連鎖關(guān)系。且-16
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