E-鈣粘蛋白基因多態(tài)性與食管癌、賁門(mén)癌的關(guān)聯(lián)研究.pdf

1、目的：E-鈣粘蛋白(E-cadherin，CDH1)是鈣粘蛋白家族中的一個(gè)成員，與腫瘤侵襲轉(zhuǎn)移密切相關(guān)。該基因具有高度多態(tài)性，其啟動(dòng)子區(qū)及非編碼區(qū)存在的多態(tài)性位點(diǎn)可通過(guò)調(diào)控基因轉(zhuǎn)錄或蛋白表達(dá)水平而影響腫瘤的發(fā)生和發(fā)展。本研究旨在探討該基因啟動(dòng)子區(qū)-160C/A和-347G/GA以及3’非編碼區(qū)(untranslatedregion,UTR)+54C/T單核苷酸多態(tài)性(singlenucleotidepolymorphism，SNP)與中

2、國(guó)北方人食管鱗狀細(xì)胞癌(esophagealsquamouscellcarcinoma，ESCC)、賁門(mén)腺癌(gastriccardiacadenocarcinoma，GCA)易感性和淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的關(guān)系。 方法：采用基于醫(yī)院的病例-對(duì)照研究方法，收集572例腫瘤患者(333例ESCC，239例GCA)和343例健康對(duì)照個(gè)體的靜脈抗凝5ml，同時(shí)記錄其病史、個(gè)人史、腫瘤家族史。以蛋白酶K消化-飽和氯化鈉鹽析法提取外周血白細(xì)胞DNA，

3、采用聚合酶鏈反應(yīng)-限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性(polymerasechainreaction-restrictionfragmentlengthpolymorphism，PCR-RFLP)方法檢測(cè)CDH1的三種多態(tài)性基因型。 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析采用SPSS12.0版軟件包(SPSSCompany,Chicago，Illinois，USA)進(jìn)行，P＜0.05認(rèn)為有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。經(jīng)比較各位點(diǎn)基因型頻率的觀察值與預(yù)期值并進(jìn)行卡方檢驗(yàn)行Hardy-W

4、einberg平衡分析。病例組與對(duì)照組的基因型分布比較采用行×列表卡方檢驗(yàn)。單體型頻率及連鎖不平衡分析采用EH軟件和2LD軟件(1.2version，RockefellerUniversity，NewYork)。以非條件Logistic回歸法計(jì)算經(jīng)年齡、性別校正的相對(duì)風(fēng)險(xiǎn)度的比值比(oddsratio,OR)及其95％可信區(qū)間(confidenceinterval,CI)。 結(jié)果：1ESCC和GCA患者組中上消化道腫瘤(uppe

5、rgastrointestinascancers,UGIC)家族史陽(yáng)性者的比例(分別為29.3％和38.4％)顯著高于健康對(duì)照組(4.8％)(x2=29.36和44.14，P＜0.0001)。ESCC患者組的吸煙者比例(49.3％)與健康對(duì)照組(41.4％)相比無(wú)顯著性差異(x2=3.00，P=0.08)；而GCA患者組的吸煙者比例(54.8％)顯著高于健康對(duì)照組(x2=7.47，P=0.006)。 2健康對(duì)照組、ESCC患者組

6、和GCA患者組中的CDH1多態(tài)基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡(P＞0.O5)。CDH1-160C/A和-347G/GASNPs基因型和等位基因型總體分布在ESCC、GCA患者組和健康對(duì)照組之間均無(wú)顯著性差異(P＞0.05)。CDH1+54C/TSNP的C等位基因頻率在ESCC、GCA患者組(分別為39.3％和48.3％)均顯著高于健康對(duì)照組(34.1％)(x2=3.98和23.73，P=0.046和0.000)。與-3

7、47G/G基因型相比，攜帶GA等位基因(即G/GA+GA/GA基因型)則可顯著增加GCA的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)(OR=1.45，95％CI=1.03～2.04)。與+54T/T基因型相比，攜帶C等位基因(即C/T+C/C基因型)可顯著增加ESCC和GCA的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)，經(jīng)性別、年齡校正后的OR值分別為1.45(95％CI=1.06～1.99)和2.28(95％CI=1.58～3.30)。 3根據(jù)個(gè)體吸煙狀況進(jìn)行分層分析發(fā)現(xiàn)，CDH1+54C/T

8、SNP等位基因型分布在ESCC和GCA非吸煙組均顯著高于健康非吸煙組(x2=4.67和5.96，P=0.03和0.02)。與T/T基因型相比，攜帶C等位基因(即C/T+C/C基因型)可使非吸煙個(gè)體ESCC和GCA的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)增加約2～3倍(0R=1.68和2.64，95％CI=1.01～2.80和1.43～4.87)。然而，在吸煙的患者和健康個(gè)體中，CDH1+54C/TSNP基因型和等位基因型分布均無(wú)顯著性差異(P＞0.05)。另外，該分

9、層分析并未發(fā)現(xiàn)CDH1-160C/A和-347G/GASNPs對(duì)ESCC和GCA發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)的影響。 4根據(jù)有無(wú)UGIC家族史分層分析發(fā)現(xiàn)，與CDH1+54C/TSNP的T/T基因型相比，攜帶C等位基因(即C/T+C/C基因型)可顯著增加UGIC家族史陰性的ESCC和GCA的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)，經(jīng)性別、年齡校正后的OR值分別為1.50(95％CI=1.00～2.27)和[1.93(95％CI=1.18～3.18)。而CDH1+54C/TSNP

10、并不影響UGIC家族史陽(yáng)性個(gè)體的ESCC和GCA的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)，表明該多態(tài)性可能影響散發(fā)人群ESCC和GCA的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)。該分層分析并未發(fā)現(xiàn)CDH1-160C/A和-347G/GASNPs對(duì)ESCC和GCA發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)的影響。 5根據(jù)獲得的相關(guān)淋巴結(jié)資料進(jìn)行分層分析發(fā)現(xiàn)，CDH1基因三種SNPs在有淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移組和無(wú)淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移組之間均無(wú)顯著性差異(P＞0.05)。 6應(yīng)用EH和2LD軟件對(duì)CDH1啟動(dòng)子區(qū)-160C/A和-347G/

11、GASNP位點(diǎn)進(jìn)行的聯(lián)合分析顯示，兩個(gè)多態(tài)性位點(diǎn)間存在連鎖不平衡現(xiàn)象(D'=0.999668，x2=53.13，P=0.000)，CDH1-160bp處的C等位基因易與-347bp處的G等位基因連鎖。CDH1單體型分布在ESCC患者組與健康對(duì)照組間存在顯著性差異(x2=11.81，P=0.008)，而GGCA患者組和健康對(duì)照組間分布相似。與-160C/-347G單體型相比，攜帶-160A/-347GA單體型顯著增加ESCC發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)，相對(duì)

12、風(fēng)險(xiǎn)度為24.26(95％CI=3.25～180.87)。然而，CDH1基因三個(gè)SNP位點(diǎn)聯(lián)合分析結(jié)果發(fā)現(xiàn)，-160C/-347G/+54T單體型是人群中最常見(jiàn)的，且該單體型分布在GCA組顯著高于健康對(duì)照組(x2=27.63，P=0.000)，而在ESCC患者組中并沒(méi)有發(fā)現(xiàn)此趨勢(shì)(x2=5.17，P=0.64)；與-160C/-347G/+54T單體型相比，攜帶-160C/-347G/+54C和-160C/-347GA/+54C單體型可

13、顯著增加GCA發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)，相對(duì)風(fēng)險(xiǎn)度分別為1.80(95％CI=1.33～2.44)和2.21(95％CI=1.43～3.42)。根據(jù)吸煙狀況、UGIC家族史及淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移情況的分析均未發(fā)現(xiàn)任何一種CDH1單體型對(duì)ESCC和GCA的發(fā)病及其淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的影響。 結(jié)論： 1上消化道腫瘤家族史明顯增加ESCC、GCA的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)。 2CDH1-160C/ASNP不單獨(dú)影響ESCC、GCA的發(fā)病及其淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移9 3與-

14、347G/G基因型相比，攜帶GA等位基因(即G/GA+GA/GA基因型)可顯著增加GCA的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)。 4CDH1-160C/A和-347G/GASNP位點(diǎn)存在明顯的連鎖不平衡，-160C等位基因易與-347G等位基因連鎖。與-160C/-347G單體型相比，攜帶-160A/-347GA單體型顯著增加ESCC發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)。 5與3'UTR+54T/T基因型相比，攜帶C等位基因(即C/T+C/C基因型)可顯著增加ESCC和GCA