陸地棉谷胱甘肽過氧化物酶家族序列和功能初步分析.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、谷胱甘肽過氧化物酶(Glutathione peroxidase,GPX)是清除活性氧的一類主要酶。許多關于GPX的研究發(fā)現(xiàn),GPX家族在植物應答和防御生物和非生物脅迫中都發(fā)揮著重要作用。本論文主要以陸地棉為研究對象,通過生物信息學分析、組織表達分析、亞細胞定位研究和GPX的活檢測等手段,對陸地棉GPX家族的基因序列進行歸納、分析和初步的功能檢測。
  我們根據(jù)擬南芥GPX家族氨基酸序列,利用BLASTp分析工具,在中棉所數(shù)據(jù)庫中

2、發(fā)現(xiàn)陸地棉的12個GhGPX基因,分別命名GhGPX1-GhGPX12,它們分別位于A基因組和D基因組。生物信息學分析發(fā)現(xiàn),GhGPX家族的12個基因的氨基酸序列,具有典型的GPX結構中的三個保守結構域和三個半胱氨酸位點;除了GhGPX5和GhGPX11的蛋白質分別為562個和245個氨基酸,其他GhGPX基因的氨基酸序列長度在156-171之間。分子量也都在18-19KD之間。對GhGPX蛋白質序列進行亞細胞定位預測分析,結果表明 G

3、hGPX1可能位于葉綠體,GhGPX5可能位于線粒體或者是葉綠體,其余的10個GhGPX可能位于胞質。從水稻、楊樹、擬南芥和陸地棉的進化樹比較分析中發(fā)現(xiàn),陸地棉中的GPX與其余的幾個物種GPX間同源性較低。
  定量PCR分析發(fā)現(xiàn),GhGPX1、GhGPX4、GhGPX6、GhGPX7、GhGPX8和GhGPX12在棉花的根、莖、真葉和子葉中都有表達,其中GhGPX1在真葉中表達量最高。對不同的非生物脅迫下棉花幼苗的GPX基因表達

4、分析發(fā)現(xiàn),35℃高溫能誘導葉片中的GhGPX7表達,35℃高溫處理陸地棉24 h時后,根中 GhGPX1、GhGPX6、GhGPX7、GhGPX8和GhGPX12表達量都有明顯的提升;根中的GhGPX6和葉中的GhGPX12受NaCl誘導表達,其表達量約為原來的三倍;當用FeSO4處理時,葉片中的GhGPX1、GhGPX6、GhGPX7、GhGPX8和GhGPX12都呈現(xiàn)表達量先上調后下降的表達模式;當用ABA處理時,葉中GhGPX12

5、的表達量上調四倍左右;當用MeJA涂抹棉花的幼葉3 h后,GhGPX4基因的表達量上調了二十倍左右;在用SA涂抹棉花的葉片時,GhGPX1和GhGPX4的表達量均有所上調。利用擬南芥葉肉細胞原生質體轉化系統(tǒng)表達GhGPX蛋白,通過激光共聚焦顯微鏡觀察發(fā)現(xiàn), GhGPX1-GFP融合蛋白定位于葉綠體, GhGPX2-GFP,GhGPX4-GFP,GhGPX6-GFP,GhGPX7-GFP和 GhGPX9-GFP定位于細胞質。利用酵母 GP

6、X3功能缺失突變體,將 GhGPX基因轉到 GPX3酵母突變體中,分析發(fā)現(xiàn)轉入GhGPX2、GhGPX4、GhGPX6和 GhGPX7能增強酵母 GPX3突變體抗氧化性,表明GhGPX2、GhGPX4、GhGPX6和GhGPX7具有清除活性氧的功能。
  綜上所述,本研究鑒定了陸地棉中的GPX家族的12個基因,這些基因在棉花的不同組織中表達量不同,可能定位于細胞質和葉綠體中;GhGPX廣泛應答于各種非生物脅迫,具有清除活性氧的功能

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