衰老相關的外周全血基因表達與DNA甲基化標志物的可重復性.pdf

1、衰老的主要特征是生理功能的退化,這種退化具有較大的個體差異性。確定可靠、易測的衰老生物學標志物以代替時序年齡進行衰老評估對阿茲海默癥(Alzheimer’s disease)等衰老相關疾病的發(fā)病機理研究及輔助診斷具有重要的意義。利用易于臨床獲取的外周全血,越來越多的研究發(fā)現(xiàn)了一些在外周全血中與衰老相關的基因表達與DNA甲基化標志物,但目前還缺少研究系統(tǒng)地評價這些衰老相關標志物的可重復性。
　　我們首先利用來自不同實驗室的多套外周全

2、血的表達譜和甲基化譜數(shù)據(jù)集,分別分析了由獨立數(shù)據(jù)集獲得的與衰老相關的基因表達和DNA甲基化標志物是否具有顯著的一致性。結果發(fā)現(xiàn)在不同數(shù)據(jù)集中找到的與年齡相關的差異表達基因(age-associated differentially expressed genes, aDEG)或差異甲基化位點(age-associated differentially methylated sites, aDMS)均具有顯著的一致性(p<4.72*E-0

3、5),表明利用芯片高通量技術在全血中獲得的與衰老相關的基因表達與DNA甲基化標志物具有可重復性。我們進一步利用去卷積算法估計了各樣本中主要白細胞亞型的比例,并分析了特定亞型白細胞上衰老相關分子的改變。結果顯示:
　　(1)隨著年齡增加,全血中髓系細胞的比例顯著增加而淋巴細胞的比例顯著減少;
　　(2)在全血中觀察到的aDEG主要反映血細胞的組分隨年齡改變而產(chǎn)生的差異表達信號;
　　(3)在全血中觀察到的aDMS主要反映

4、血細胞上的甲基化異常。
　　最后,我們分別將在正常人外周全血中觀察到的aDEG、aDMS與在阿茲海默癥患者的外周全血或白細胞中發(fā)現(xiàn)的相應分子標志物進行比較,結果顯示:
　　(1)和整個年齡段的aDMS相比,在外周全血中65歲以上的aDMS與阿茲海默癥相關的差異甲基化基因有較高的一致性,其中已知一些基因可作為潛在的阿茲海默癥的分子標記;
　　(2)血細胞上的aDEG與阿茲海默癥相關的差異表達基因之間沒有顯著的關聯(lián)。