葡萄糖調(diào)節(jié)蛋白78基因多態(tài)性與乙型肝炎病毒、原發(fā)性肝細(xì)胞癌易感性和預(yù)后的相關(guān)性研究.pdf

1、中山大學(xué)博士學(xué)位論文葡萄糖調(diào)節(jié)蛋白78基因多態(tài)性與乙型肝炎病毒、原發(fā)性肝細(xì)胞癌易感性和預(yù)后的相關(guān)性研究姓名：朱蕭申請學(xué)位級別：博士專業(yè)：生物化學(xué)與分子生物學(xué)指導(dǎo)教師：孔祥復(fù)20090603葡萄糖調(diào)節(jié)蛋白78基因多態(tài)性與乙型肝炎病毒、原發(fā)性肝細(xì)胞癌易感性和預(yù)后的相關(guān)性研究的關(guān)系。2材料和方法410份華南地區(qū)健康漢族人的基因組GRP78基因的PCR產(chǎn)物直接被測序，包括了該基因的啟動子區(qū)、所有的外顯子區(qū)、3’非翻譯區(qū)(3’untranslat

2、edregion，3’UTR)，和大部分的內(nèi)含子。在年齡和性別上與正常對照組相匹配的392份HBV感染組和428份HCC組，針對所發(fā)現(xiàn)的SNPs，在熒光定量PCR儀(ABIPrism7900HT，AppliedBiosystems，F(xiàn)osterCity，CA)上使用TaqManMGB—probes基因分型技術(shù)，或使用測序技術(shù)進(jìn)行基因分型。連鎖不平衡(Linkagedisequilibrium，LD)和單體型(haplotypes)的構(gòu)建

3、使用Haploviewversion32。雙體型(diplotypes)的構(gòu)建通過以最大期望值(expectationmaximizationEM)算法為基礎(chǔ)的PENHAPLO程序?qū)崿F(xiàn)。HBV感染的血清學(xué)標(biāo)記物的檢驗通過酶聯(lián)免疫吸附檢驗(enzyme1inkedimmunosorbentassayELISA)或常規(guī)化學(xué)檢驗。HBVDNA的定量通過使用商品化的HBV熒光定量PCR診斷試劑盒(ShenzhenPGBiotech，China)

4、，并在LightCyclerTMSystems(RocheDiagnositc，RotkreuzSwitzerland)k進(jìn)行。通過GENEPOPversion40遺傳軟件檢驗對照組及疾病組基因型分布的HardyWeinberg平衡。Chisquare檢驗被用在疾病組和對照組在性別、吸煙和飲酒習(xí)慣上的可能差異。而他們在年齡上的可能差異使用MannWhitneyU檢驗。疾病組和對照組(或不同疾病組之間)在等位基因、基因型、單體型和雙體型水

5、平上的差異，使用校正了年齡、性別、吸煙和飲酒習(xí)慣的無條件logistic回歸模型，同時計算優(yōu)勢比(oddsratios，OR)和95％的可信區(qū)間(confidenceintervals，CIs)。HBV組中，血清HBVDNA的水平與等位基因、基因型、單體型和雙體型的聯(lián)系，使用單因素的方差分析(Onewayanalysisofvariance，ANOVA)和Bonferroni檢驗。所有的統(tǒng)計都是雙側(cè)檢驗。以尸值小于005或小于保守性的閾