基于SSR標(biāo)記的西瓜DNA指紋圖譜的構(gòu)建.pdf

1、西瓜(Citrullus lanatus)屬葫蘆科，是一種具有悠久栽培歷史的世界性的園藝作物;是我國重要的蔬菜作物，在農(nóng)業(yè)結(jié)構(gòu)調(diào)整與農(nóng)民增收中發(fā)揮著重要作用。利用已獲得的最大限度準(zhǔn)確反映遺傳多樣性關(guān)系的核心引物組合，建立了西瓜品種DUS分子測(cè)試技術(shù)，并構(gòu)建了標(biāo)準(zhǔn)品種的DNA指紋圖譜;同時(shí)利用這一技術(shù)對(duì)建庫的788份西瓜材料進(jìn)行了群體結(jié)構(gòu)分析;通過基于計(jì)算機(jī)系統(tǒng)的指紋圖譜庫管理系統(tǒng)，形成了人機(jī)對(duì)話模式。具體內(nèi)容如下:
　　 1.采

2、用23個(gè)核心引物組合和56個(gè)形態(tài)標(biāo)記分析西瓜DUS測(cè)試指南中24份標(biāo)準(zhǔn)品種的遺傳多樣性。核心引物組合共擴(kuò)增73個(gè)多態(tài)性位點(diǎn)，多態(tài)性比率為73.74％，PIC值平均值為0.38;在遺傳相似系數(shù)0.80處將24份標(biāo)準(zhǔn)品種分為3類。利用56個(gè)形態(tài)標(biāo)記，在遺傳相似系數(shù)為0.66處將標(biāo)準(zhǔn)品種分為2類，各生態(tài)類型混雜。形態(tài)相似系數(shù)和分子遺傳相似系數(shù)二者之間的相關(guān)系數(shù)僅為0.186，沒有相關(guān)性，分析結(jié)果表明:核酸指紋分類比傳統(tǒng)形態(tài)學(xué)分類更為準(zhǔn)確。

3、r>　　 2.采用二維(QR)編碼構(gòu)建了西瓜24份標(biāo)準(zhǔn)品種的SSR指紋圖譜，并利用分子測(cè)試技術(shù)進(jìn)行了DUS分子鑒定，保護(hù)品種“京欣2號(hào)”與對(duì)照品種“京欣1號(hào)”品種間遺傳相似系數(shù)為0.89，比形態(tài)學(xué)鑒定的差異位點(diǎn)更多。
　　 3.利用PowerMarker3.25軟件對(duì)788份西瓜種質(zhì)資源材料進(jìn)行遺傳多樣性分析，在遺傳距離為0.477處將788份資源分為5類，即美洲生態(tài)型、東亞生態(tài)型、野生種、egusi類型及Citroides類