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1、THEAPPLICATIoNoFBIoPRoBEINTHEDETECTIoNoFDNADAMAGEAThesisSubmittedtoSoutheastUniversityFortheAcademicDegreeofMasterofScienceBYXiongYanxiangSupervisedbyAssociateProfessorWeiWIeiSchoolofChemistryandChemicalEngineeringSouthe
2、astUniversityJune2014論文名稱:生物探針在DNA損傷檢測中的應(yīng)用研究學(xué)生姓名:熊艷翔指導(dǎo)老師:衛(wèi)偉學(xué)校名稱:東南大學(xué)摘要DNA是機體生命活動最重要的遺傳物質(zhì),其分子結(jié)構(gòu)完整性和穩(wěn)定性的保持對于細胞的存活和正常生理活動的發(fā)揮具有重要意義。外界環(huán)境因素造成的DNA損傷以及基因本體在復(fù)制后修飾過程中出現(xiàn)的異常會導(dǎo)致腫瘤、胚胎發(fā)育障礙等多種疾病,對DNA損傷的研究也越來越具有生物學(xué)意義。因此建立準確性好、靈敏度高、操作簡單的
3、DNA損傷檢測方法可以為某些疾病的早期預(yù)防和診斷提供重要的依據(jù)。本文圍繞DNA損傷開展了如下兩方面的工作:DNA發(fā)卡結(jié)構(gòu)通常是由分子內(nèi)雙鏈堿基問的沃森克里克氫鍵作用力形成的。本論文研究內(nèi)容之一是利用基于銀離子調(diào)節(jié)的c—Ag一c作用力形成的分子信標來檢測DNA損傷。這種金屬離子調(diào)節(jié)形成的探針DNA較傳統(tǒng)的發(fā)卡型結(jié)構(gòu)探針更靈活,更易變換結(jié)構(gòu)。在此基礎(chǔ)上,我們結(jié)合DNA鏈置換反應(yīng)設(shè)計了一種簡單,快捷檢測DNA的方法。這種方法能夠靈敏檢測DNA
4、,特異性強,可以區(qū)分單堿基錯配,并成功運用于檢測一些有毒化學(xué)試劑,如氧化苯乙烯和亞砷酸鈉引起的DNA損傷。傳統(tǒng)的甲基化檢測方法如凝膠電泳,操作繁瑣且耗時。本文中,我們發(fā)展了一種基于氧化石墨烯和限制性內(nèi)切酶HpalI的熒光檢測DNA甲基化的新方法。HpalI能夠特異性識別切割雙鏈序列5CCGG3’。末端修飾FAM的探針DNA和目標DNA雜交形成雙鏈DNA,探針DNA比目標DNA多l(xiāng)o個堿基。通過調(diào)節(jié)氧化石墨烯的濃度使得雙鏈DNA未能完全脫
5、離氧化石墨烯表面,此時熒光仍然被猝滅。但是當加入限制性內(nèi)切酶HpalI后,HpaII特異性識別雙鏈5CCGG一3’序列并且切割,形成修飾FAM的小片段DNA,這些修飾FAM的小片段DNA則不會依附在氧化石墨烯表面,熒光恢復(fù)。如果用甲基化轉(zhuǎn)移酶(MSssI)、二甲亞砜(DMSO)和乙醛(CH3CHO)處理DNA后,體系熒光無法恢復(fù)。據(jù)此,可建立DNA甲基化的熒光檢測新方法,該方法簡單,快速,有效,在甲基化酶抑制劑藥物篩選方面有很大的應(yīng)用潛
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