優(yōu)質(zhì)麥籽發(fā)育轉(zhuǎn)錄組構(gòu)建及品質(zhì)相關(guān)基因的挖掘.pdf

1、小麥的加工品質(zhì)在很大程度上取決于蛋白質(zhì)含量和質(zhì)量，而小麥出粉率也是決定其是否優(yōu)質(zhì)的重要因素。本研究以優(yōu)質(zhì)強(qiáng)筋小麥鄭麥366(A1)和優(yōu)質(zhì)弱筋小麥鄭麥004(A2)為材料，利用RNA-seq技術(shù)構(gòu)建優(yōu)質(zhì)麥籽粒發(fā)育轉(zhuǎn)錄組，以轉(zhuǎn)錄組研究獲得的Unigene為基礎(chǔ)，利用生物信息學(xué)的方法挖掘在強(qiáng)筋和弱筋材料中差異表達(dá)的基因，得到品質(zhì)相關(guān)的基因。研究結(jié)果為:
　　1.優(yōu)質(zhì)小麥籽粒發(fā)育轉(zhuǎn)錄組測(cè)序及數(shù)據(jù)庫(kù)建立
　　通過(guò)高通量測(cè)序技術(shù)，A1獲

2、得63，258，020條Cleanreads，cycleQ20比率為92.35％;A2獲得64，827，022條Cleanreads，cycleQ20比率為95.12％。對(duì)Cleanreads進(jìn)行Conting組裝、Scaffolds拼接以及補(bǔ)洞處理后，共得到114，418條Unigenes。
　　2.優(yōu)質(zhì)小麥籽粒發(fā)育轉(zhuǎn)錄組功能注釋及代謝通路分析
　　將得到的Unigenes分別比對(duì)到nr、GO、COG、KEGG和Swiss

3、-Prot蛋白數(shù)據(jù)庫(kù)。各個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì)結(jié)果為:
　　(1)nr注釋:在所有的Unigenes中，存在有68，787個(gè)可以直接確定其CDS區(qū)及序列方向，該部分Unigenes占到其總數(shù)的60.12％。
　　(2)GO功能分類:共計(jì)存在45，708條Unigenes被注釋到63種功能類別中，功能分類結(jié)果表明，存在著大量參與小麥籽粒生長(zhǎng)發(fā)育過(guò)程中調(diào)控細(xì)胞代謝、和生理過(guò)程等的基因。
　　(3)COG功能分類:存在13，233條U

4、nigenes被注釋到25個(gè)功能類別中，參與蛋白質(zhì)、淀粉合成相關(guān)的基因在小麥籽粒生長(zhǎng)發(fā)育過(guò)程中起到了關(guān)鍵性的調(diào)控作用。
　　(4)KEGG代謝通路分析:存在8，629個(gè)基因被注釋到118個(gè)信號(hào)通路中。其中，蛋白質(zhì)合成與加工、激素調(diào)控、淀粉和蔗糖代謝作用等信號(hào)通路在小麥籽粒生長(zhǎng)發(fā)育過(guò)程起到重要調(diào)控作用。
　　3.優(yōu)質(zhì)小麥品質(zhì)相關(guān)基因的挖掘
　　通過(guò)生物信息學(xué)方法，獲得在鄭麥366和鄭麥004中差異表達(dá)的基因共375個(gè)。在