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1、根據(jù)已發(fā)表的羊傳染性膿皰病毒NZ2株的基因序列,應(yīng)用計(jì)算機(jī)程序設(shè)計(jì)合成一對(duì)針對(duì)羊傳染性膿皰病毒GIF基因的特異性引物,對(duì)羊傳染性膿皰病毒內(nèi)蒙分離株OV-nm-05進(jìn)行PCR擴(kuò)增,擴(kuò)增產(chǎn)物與pEASY—T1載體連接,轉(zhuǎn)化至感受態(tài)大腸桿菌DH5a中,成功得到GIF基因的陽(yáng)性克隆,送測(cè)序公司進(jìn)行測(cè)序得到該病毒GIF的基因序列。該病毒GIF基因序列長(zhǎng)約1280bp左右,其中包括GIF基因的編碼區(qū)和左右兩邊的非編碼區(qū)。應(yīng)用計(jì)算機(jī)軟件將測(cè)定的基因序
2、列及其推導(dǎo)的氨基酸序列與7株參考毒株進(jìn)行比較。
結(jié)果表明,內(nèi)蒙古分離株OV-nm-05堿基序列與OV-NZ2、OV-D1701、OV-IA82、OV-SA00、OV-F07.808R、OV-MUK59/05、OV-F94.848R的同源性分別為95.7%、98.2%、96.7%、95.5%、95.9%、95.5%、95.1%;氨基酸序列同源性分別為95.1%、90.2%、95.1%、94.7%、94.7%、95.1%、93.6
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