嶗山奶山羊ACACA和SCD基因多態(tài)性與泌乳性狀的關(guān)聯(lián)分析.pdf

1、奶山羊泌乳性狀的遺傳力較低,采用常規(guī)育種手段雖使其獲得了一定的遺傳進展,但進展較為緩慢,故尋找主效遺傳標記對提高嶗山奶山羊的泌乳性能是十分必要的。本研究分析ACACA基因啟動子PⅢ和SCD基因外顯子3及側(cè)翼序列的多態(tài)性及其對泌乳性狀的影響,探討與嶗山奶山羊泌乳性狀相關(guān)聯(lián)的分子遺傳標記,為嶗山奶山羊的品種選育提供分子依掘。本研究以174只嶗山奶山羊泌乳母羊作為研究對象,利用PCR-DHPLC技術(shù)和直接測序法相結(jié)合檢測ACACA基因啟動子P

2、Ⅲ序列多態(tài)性;用PCR產(chǎn)物直接測序法檢測SCD基因外顯子3及側(cè)翼序列多態(tài)性;用Popgen3.2軟件分析多態(tài)性位點的遺傳多態(tài)性:用SAS9.2軟件分析體尺、體重指標與泌乳性狀間的相關(guān)性以及基因多態(tài)性與泌乳性狀間的關(guān)聯(lián)效應。結(jié)果表明:
　　 (1)在ACACA基因啟動子PⅢ部分序列中檢測到3個SNPs,即第1206位的B/D,1255位的A/C和1322位的M/N,其等位基因和基因型頻率在種羊場(F)和農(nóng)戶(P)兩個群體中分布不均

3、衡,但均處于Hardy-Weinberg平衡狀態(tài)(P＞0.05)。在SCD基因外顯子3及側(cè)翼區(qū)檢測到4個SNPs,即E315 E/e、E368H/h,內(nèi)含子3的I346 R/r和I355Q/q,其等位基因和基因型頻率在樣本群中均處于Hardy-Weinberg平衡狀態(tài)(P＞0.05)。其中E315E/e和I355 Q/q的分布情況一致,呈緊密連鎖關(guān)系。
　　 (2)體重、體高和體長與各乳成分呈顯著或極顯著負相關(guān),體長與產(chǎn)奶量呈顯

4、著正相關(guān),體重和胸圍與產(chǎn)奶量呈極顯著正相關(guān)。
　　 (3)在整個樣本群體中,大部分泌乳性狀均存在顯著的場別效應(P＜0.01或P＜0.05),而ACACA基因啟動子PⅢ所有位點的基因型效應均不顯著(P＞0.05),在F群體的1206位點上,等位基因B為乳蛋白率、乳糖率、非脂肪物性狀的有利等位基因,BB基因型與BD基因型的乳蛋白率和乳糖率性狀差異極顯著(P＜0.01),非脂肪物和乳密度性狀差異顯著(P＜0.05),BB基因型與BD

5、基因型,乳蛋白率、乳糖率和非脂肪物性狀均存在顯著的等位基因替代效應(P＜0.05);而在P群體中,兩種基因型間的所有性狀則差異不顯著(P＞0.05)。在F群體的1322位點上,等位基因N為乳糖率的有利等位基因,為300d產(chǎn)奶量的不利等位基因,MN基因型與MM基因型的300d產(chǎn)奶量和乳糖率性狀差異顯著(P＜0.01或P＜0.05),其等位基因替代效應分別為-52.22kg和0.12％(P＜0.01);而在P群體中,等位基因M為乳蛋白率、乳

6、糖率、非脂肪物、乳密度的有利等位基因,乳糖率和非脂肪物的等位基因替代效應分別為-0.25％和-0.44％(P＜0.05)。
　　 (4)SCD基因E315和1355位點的EE/QQ基因型與基因型ee/qq的所有乳成分性狀差異顯著(P＜0.05)或極顯著(P＜0.01),EE/QQ與Ee/Qq基因型的乳蛋白率、乳密度差異顯著(P＜0.05),等位基因E/Q為乳成分性狀的有利等位基因;各乳成分性狀的基因加性效應極顯著(P＜0.01)

7、,顯性效應不顯著(P＞0.05)。E368位點hh基因型與HH和Hh基因型的所有乳成分性狀差異顯著(P＜0.05)或極顯著(P＜0.01),等位基因h為乳成分性狀的有利等位基因;所有乳成分的基因加性效應和顯性效應極顯著(P＜0.01)。1346位點rr基因型的300d產(chǎn)奶量極顯著(P＜0.01)高于RR基因型,等位基因r為300d產(chǎn)奶量的有利等位基因,但其對乳成分性狀的影響不顯著(P＞0.05)。在不同試驗群體中分析SCD基因多態(tài)性與泌