棉花黃萎病抗性的分子標記研究.pdf

1、以陸地棉TM-1和?？姑夼渲品N內(nèi)雜交組合構(gòu)建RIL作圖群體,通過SSR分子標記技術(shù)手段進行陸地棉遺傳連鎖圖譜構(gòu)建和黃萎病抗性QTL定位研究。為提高試驗的精準度,在研究過程中分別選取大田和病圃作為棉花黃萎病病指鑒定的不同環(huán)境條件,且每個條件下又設(shè)3次重復(fù)試驗,結(jié)果發(fā)現(xiàn),大田環(huán)境下調(diào)查所得病指符合正態(tài)分布規(guī)律,而病圃中得到的數(shù)據(jù)存在偏分離現(xiàn)象,這與病圃鑒定時感病植株的易丟失有關(guān),對于存在偏分離現(xiàn)象的表型數(shù)據(jù)用DPS軟件校正之后仍然用于陸地棉

2、抗黃萎病QTL定位研究。
　　 選取8454對SSR引物對2個親本進行標記基因型分析,多數(shù)SSR引物在陸陸品種間多態(tài)性水平較低,表現(xiàn)多態(tài)性的引物數(shù)量僅有1.43％。為提高陸地棉抗黃萎病分子標記研究的工作效率,從現(xiàn)有基因組數(shù)據(jù)庫中共收集到19條植物抗黃萎病基因及其相關(guān)序列,用于開發(fā)具有針對性的棉花抗黃萎病SSR引物,應(yīng)用軟件SSRHunter和Oligo6.0進行設(shè)計,共獲得12對SSR引物,將其用于分子標記基因型分析時,有3對引

3、物能夠在2親本間表現(xiàn)多態(tài)性。
　　 以RILs為作圖群體構(gòu)建遺傳連鎖圖譜,所得圖譜含有10個連鎖群,總標記數(shù)為85個,覆蓋基因組全長的619.5cM。標記間平均距離為0.8～11.52cM,每一連鎖群上分布的標記個數(shù)為3～14個,各連鎖群的長度位于3.2～131.9cM之間。為獲得高密度遺傳連鎖圖譜,將該圖譜同TM-1×?？姑扪苌腇2群體構(gòu)建的棉花抗黃萎病遺傳連鎖圖譜進行整合,整合之后得到的圖譜包含10個連鎖群,共有標記數(shù)95

4、個,標記間平均距離為6.9cM,覆蓋基因組全長的661.1cM。同時發(fā)現(xiàn),連鎖群數(shù)目與陸地棉單倍體的染色體數(shù)目不等的現(xiàn)象。
　　 應(yīng)用軟件WinQTLCart V2.5進行陸地棉抗黃萎病QTL檢測,當(dāng)LOD值設(shè)為6.0時,復(fù)合區(qū)間作圖法可以檢測到2個試驗環(huán)境條件下共6個陸地棉抗黃萎病QTLs,其中效應(yīng)值較大的2個QTLs全部位于第6連鎖群上,可以分別解釋表型變異的37.51％、47.25％。
　　 選取QTL定位分析中獲