真姬茹高溫脅迫應(yīng)答的蛋白組學(xué)差異表達分析.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、真姬菇(Hypsizygusmarmoreus)是一種珍稀食用菌品種,以其豐富的營養(yǎng)價值和廣泛的藥用價值深受人們的喜愛。真姬菇屬于中偏低溫型食用菌,溫度過高或過低都會對真姬菇的生產(chǎn)造成較大影響。
   本研究以真姬菇品種白真姬菇G12為材料,采用了傳統(tǒng)的TCA/丙酮法、Tris-飽和酚法及尿素裂解法提取真姬菇菌絲全蛋白,確定了Tris-飽和酚法是一種高效的真姬菇菌絲全蛋白提取方法,所提取蛋白完整性好,產(chǎn)量高,雜質(zhì)少,適用于后續(xù)蛋

2、白質(zhì)組學(xué)的研究。
   以真姬菇最適生長溫度25℃正常培養(yǎng)三周為正常組,以25℃正常培養(yǎng)三周并高溫42℃熱激2h為處理組,建立適于真姬菇菌絲全蛋白的雙向電泳體系,即采用24cm,pH4-7的IPG膠條,蛋白上樣量為1.2mg,上樣體積為480μL,被動水化時間16h。IEF程序為:100V1h;500V1h;1000V1h;8000V3h,8000V7h。SDS-PAGE的電泳條件為2W40min,17W6.5h。染色方法為膠體

3、考染過夜。通過雙向電泳技術(shù)研究比較正常組和處理組之間的蛋白質(zhì)組差異。利用軟件識別蛋白點并獲得關(guān)于差異蛋白點的分子量、等電點和相對表達豐度的信息,以及凝膠間蛋白點的匹配和定量分析信息。蛋白質(zhì)表達量差異倍數(shù)在3.0以上的12個蛋白差異點,其中4個蛋白點在處理組中表達量上調(diào),8個蛋白點下調(diào)。將蛋白質(zhì)表達量差異倍數(shù)在3.0以上的12個蛋白差異點進行MALDI-TOF-TOF-MS初步鑒定和數(shù)據(jù)庫檢索,進行功能預(yù)測及分析,有7個蛋白有質(zhì)譜信號,數(shù)

4、據(jù)庫搜索之后4個蛋白得到初步鑒定,3個蛋白為未知蛋白及預(yù)測蛋白。還有5個電腦識別的差異蛋白質(zhì)由于分辨率或靈敏度不夠,或者因匹配率覆蓋率太低未得到鑒定,因而未能進一步分析。
   這些差異蛋白大致歸為6個主要的功能類群,包括:(1)糖類和能量代謝(2)參與基因表達調(diào)控(3)蛋白質(zhì)代謝(4)細胞骨架動態(tài)變化(5)參與信號轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑(6)脅迫反應(yīng),此外還有轉(zhuǎn)錄調(diào)控相關(guān)、離子運輸、氨基酸代謝、核酸代謝、其它功能和未知功能蛋白質(zhì)。表達量上調(diào)

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