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文檔簡介
1、差異蛋白質(zhì)組學是目前蛋白質(zhì)組學研究的一種重要研究策略。它著重于篩選和鑒定不同種類或狀態(tài)下各樣本之間蛋白質(zhì)組的區(qū)別與變化,具有很強的可實現(xiàn)性。它可以確定與疾病相關(guān)的目標靶分子,為臨床診斷、病理研究、藥物篩選、新藥開發(fā)、新陳代謝研究等提供理論依據(jù)和基礎(chǔ)。 Bin1b是抗菌肽的一種,抗菌肽是生物體內(nèi)天然存在的一類具有殺滅細菌和真菌等多種病原微生物的小肽。有些抗菌肽還具有殺滅病毒和癌細胞的作用,此外有些抗菌肽還具有促進精子運動,免疫調(diào)
2、節(jié)等多種作用。此外,從基因水平上得知Bin1b還能促進未成熟精子的運動。為了深入研究Bin1b調(diào)節(jié)細胞表達的機制,本文用蛋白質(zhì)組學方法從蛋白質(zhì)水平找出由Bin1b基因高表達引起蛋白質(zhì)的變化。本文首次采用差異蛋白質(zhì)組學方法研究野牛型RM-1細胞和Bin1b穩(wěn)定轉(zhuǎn)染細胞的蛋白質(zhì)組的表達差異,得到了野生型RM-1細胞和Bin1b穩(wěn)定轉(zhuǎn)染細胞蛋白表達圖譜,找出差異蛋白并分析差異蛋白所表達的功能,找出了由Bin1b基因高表達引起蛋白質(zhì)水平的變化,
3、為研究Bin1b基因奠定了基礎(chǔ)。 本文采用了雙相凝膠電泳(Two-dimensional gel electrophoresis,2-DE)和基質(zhì)輔助激光解吸電離(matrix-assisted laster desorption/ionization,MALDI)方法研究了野生型RM-1細胞和Bin1b穩(wěn)定轉(zhuǎn)染細胞的蛋白質(zhì)組的表達差異。首先應(yīng)用雙向凝膠電泳技術(shù)對蛋白質(zhì)進行分離,每一例樣本均分別進3次雙相電泳進行重復(fù)性實驗,用P
4、DQuest分析軟件對兩組的全蛋白質(zhì)組表達譜進行差異分析,總共發(fā)現(xiàn)15個差異蛋白點(3倍以上差異)。對差異蛋白進行了膠內(nèi)酶解,酶解后的肽段用MALDI-TOF-TOF質(zhì)譜分析,將質(zhì)譜數(shù)據(jù)送入NCBI非冗余數(shù)據(jù)庫,通過MASCOT搜索引擎檢索。最后10個差異蛋白得到成功鑒定。研究中發(fā)現(xiàn)Bin1b可能通過影響微管,肌動蛋白,以及它們的相互作用改變細胞骨架結(jié)構(gòu),影響細胞的運動及細胞內(nèi)物質(zhì)運輸,并可能通過蛋白質(zhì)二硫鍵異構(gòu)酶等蛋白影響細胞外蛋白的
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