羅非魚ICER和PGRN基因cDNA序列及表達(dá)分析.pdf

1、研究對奧尼羅非魚（Oreochromis.niloticus×O.aureus）、尼羅羅非魚（O.niloticus）、奧利亞羅非魚（O.aureus）和吉富羅非魚(GIFT)的抗病力進(jìn)行了比較。通過對4種羅非魚進(jìn)行鏈球菌(Streptococcus iniae，0.2×107CFU)攻毒實(shí)驗(yàn)，發(fā)現(xiàn)奧尼羅非魚、尼羅羅非魚、奧利亞羅非魚和吉富羅非魚的死亡率分別為40.00％，48.00％，60.00％和76.00％。研究通過對羅非魚外周血

2、白細(xì)胞cDNA文庫測序所得序列進(jìn)行生物信息學(xué)分析，獲得羅非魚cAMP誘導(dǎo)早期抑制因子(inducible cAMP earlyrepressor，ICER)全長cDNA序列(GenBank登陸號為ACS88195)和顆粒蛋白前體（progranulin，PGRN）全長cDNA序列(GenBank登陸號為GQ241348)。其中，ICER cDNA克隆總長569bp，包含1個(gè)完整的開放閱讀框，編碼111個(gè)氨基酸。序列表現(xiàn)出ICERⅡγ的基

3、本結(jié)構(gòu)特征，即僅有cAMP應(yīng)答元件調(diào)控因子(CREM)亮氨酸拉鏈DNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域DBDⅡ，且無外顯子γ。PGRN cDNA克隆總長843bp，包含一個(gè)完整的開放閱讀框，編碼206個(gè)氨基酸，其中推定信號肽20氨基酸，兩個(gè)GRN重復(fù)單位均56氨基酸。鑒于ICER和PGRN基因在魚類免疫和生長發(fā)育調(diào)節(jié)中的重要作用，研究采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR方法對奧尼雜交羅非魚、尼羅羅非魚、奧利亞羅非魚和吉富羅非魚免疫和攻毒后ICER和攻毒后PGRN的表達(dá)進(jìn)行

4、定量分析。結(jié)果顯示，攻毒后4種魚的腦、肝、頭腎和脾組織的ICER表達(dá)量均不同程度下調(diào)，免疫后4種魚的腦、肝、前腎和脾組織ICER表達(dá)量均是先大幅下調(diào)，7d后又轉(zhuǎn)為上調(diào)。另外，攻毒后ICER整體表達(dá)量和免疫后期ICER上調(diào)幅度在奧尼雜交羅非魚、尼羅羅非魚、奧利亞羅非魚和吉富羅非魚中呈依次下降，與4種羅非魚的實(shí)驗(yàn)室抗鏈球菌感染能力和生產(chǎn)上抗病力呈正相關(guān)。PGRN mRNA在攻毒后4種羅非魚4種組織中表達(dá)均有上調(diào)趨勢，并且在脾中的表達(dá)量最高，