中國林蛙抗菌肽的分離純化及cDNA克隆.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、本研究通過反相高效液相法從中國林蛙皮膚分泌物中分離、純化得到3種多肽,經抑菌試驗分析表明,其中兩種多肽具有較強的抑菌活性。將其進行Tris-TricineSDS聚丙烯酰胺凝膠電泳(SDS-PAGE),測定其分子量為7.0kDa左右,經PVDF轉膜后,利用Edaman降解法分別測定其N末端10個氨基酸序列。然后應用在線程序CODEHOP(Consensus-degeneratehybridoligonucleotideprimers)設計

2、簡并引物,同時提取蛙皮總RNA,采用RT-PCR及RACE法,首次克隆得到兩條中國林蛙抗菌肽基因cDNA序列,分別命名為CAMPs-1(GenBanK登錄號:DQ471289)和CAMPs-2(GenBanK登錄號:DQ471290),CAMPs-1基因cDNA序列全長為285bp,其中包括183bp完整的開放閱讀框(openreadingframe,ORF),推測編碼61個氨基酸的多肽(chensirin-1),分子量(MW)為7.1

3、03kDa,同時含有102bp的3’非轉譯區(qū)(3'UTR);CAMPs-2基因cDNA序列全長為279bp,其中包括177bp完整的開放閱讀框(openreadingframe,ORF),推測編碼59個氨基酸的多肽(chensirin-2),分子量(MW)為6.980kDa,同時含有102bp的3’非轉譯區(qū)(3'UTR)。生物信息學分析表明,CAMPs-1和CAMPs-2氨基酸序列(即chensirin-1,chensirin-2)N末

4、端均含有一個相對保守的由22個氨基酸組成的信號肽序列。通過chensirin-1和chensirin-2與已克隆的蛙屬抗菌肽序列的Blast比對及系統(tǒng)進化樹分析顯示,其與蛙屬抗菌肽的同源性較高,分別為63﹪~86﹪和57﹪~81﹪,說明chensirin-1和chensirin-2為蛙屬抗菌肽家族的兩個新成Z員。 綜上所述,利用3’RACE技術首次從中國林蛙皮膚中分離到中國林蛙抗菌肽基因CAMPs-1、CAMPs-2,并對其基因

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