細(xì)粒棘球絳蟲(chóng)原頭蚴蛋白質(zhì)組學(xué)研究及生物信息學(xué)分析.pdf

1、目的：在前期研究的基礎(chǔ)上,通過(guò)雙向電泳條件的優(yōu)化,對(duì)細(xì)粒棘球絳蟲(chóng)原頭蚴進(jìn)行蛋白質(zhì)組學(xué)和生物信息學(xué)分析,進(jìn)一步研究原頭蚴蛋白質(zhì)的基礎(chǔ)構(gòu)成和功能情況,尋找具有特異性的靶標(biāo)蛋白,為包蟲(chóng)病的早期診斷、新藥開(kāi)發(fā)、疫苗篩選,提供理論依據(jù)。
　　方法：1.取寧夏醫(yī)科大學(xué)總醫(yī)院肝膽外科包蟲(chóng)病人術(shù)后的包囊,經(jīng)無(wú)菌分離細(xì)粒棘球絳蟲(chóng)原頭蚴。2.對(duì)原頭蚴蛋白質(zhì)樣品并進(jìn)行雙向電泳分離,并對(duì)雙向電泳條件進(jìn)行優(yōu)化。3.選擇分離的蛋白點(diǎn)進(jìn)行MALDI-TOF/M

2、S檢測(cè)得到肽指紋圖譜PMF。4.將PMF數(shù)據(jù)提交到互聯(lián)網(wǎng)中蛋白信息研究數(shù)據(jù)庫(kù)中,與已有的蛋白信息進(jìn)行匹配分析,初步鑒定出樣本中蛋白質(zhì),通過(guò)COGs(ClustersofOrthologousGroupsofproteins)蛋白質(zhì)直系同源簇?cái)?shù)據(jù)庫(kù)、GO(GeneOntology)蛋白質(zhì)功能分類數(shù)據(jù)庫(kù)、KEGGpathway蛋白質(zhì)代謝通路數(shù)據(jù)庫(kù),分析這些蛋白的功能與性質(zhì)。5.利用免疫印跡的方法,用包蟲(chóng)病人的血清識(shí)別原頭蚴抗原,并進(jìn)行質(zhì)譜鑒

3、定及生物信息學(xué)分析。
　　結(jié)果：1.通過(guò)原頭蚴蛋白質(zhì)樣品的雙向電泳分析,獲得了330個(gè)蛋白點(diǎn)。2.從雙向電泳凝膠上切下來(lái)的蛋白點(diǎn)通過(guò)MALDI-TOFMS質(zhì)譜檢測(cè),原頭蚴樣品中有157個(gè)蛋白點(diǎn)獲得了肽指紋圖譜(PMF)數(shù)據(jù)。3.初步鑒定了細(xì)粒棘球蚴原頭蚴中的部分蛋白點(diǎn),共有49個(gè)蛋白點(diǎn)。4.對(duì)鑒定得到的蛋白點(diǎn),我們進(jìn)行了生物信息學(xué)的初步分析,發(fā)現(xiàn)這些蛋白主要與細(xì)胞組成、新陳代謝、信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)以及物質(zhì)運(yùn)輸有關(guān)。5.對(duì)原頭蚴蛋白利用包蟲(chóng)病