多性狀遺傳數(shù)據(jù)的基因關(guān)聯(lián)檢驗(yàn).pdf

1、隨著基因測(cè)序技術(shù)的高速發(fā)展，人們能夠從分子水平來(lái)探索復(fù)雜疾病的成因。大多復(fù)雜疾病都是由基因決定的，因此可通過(guò)疾病與基因位點(diǎn)之間的的關(guān)聯(lián)進(jìn)行精準(zhǔn)診斷。研究發(fā)現(xiàn)除常見(jiàn)變異外，一些罕見(jiàn)變異也解釋了人類疾病表型方差的一部分。因罕見(jiàn)變異的重要性，需提出統(tǒng)計(jì)方法來(lái)檢驗(yàn)罕見(jiàn)變異與疾病之間的關(guān)聯(lián)，且在人類基因組中越來(lái)越多的罕見(jiàn)變異被發(fā)現(xiàn)，這也為罕見(jiàn)變異的研究提供了可能性。復(fù)雜疾病的性狀通常需記錄成多種表現(xiàn)形式:如表型呈連續(xù)性分布的數(shù)量性狀，間斷分布的二

2、分類及有序性狀等，且多性狀的遺傳基礎(chǔ)大都表現(xiàn)為與多個(gè)變異位點(diǎn)之間的關(guān)系，因此對(duì)復(fù)雜疾病的探究就不能只看單一性狀與多位點(diǎn)之間的關(guān)聯(lián)，而需同時(shí)考慮多個(gè)性狀的聯(lián)合信息。家庭成員之間因有更多機(jī)會(huì)共享相同的因果變異，故基因異質(zhì)性相對(duì)較小，基于家系設(shè)計(jì)的罕見(jiàn)變異與多性狀之間的關(guān)聯(lián)檢驗(yàn)將會(huì)是一個(gè)很好的策略。
　　本文在常見(jiàn)疾病罕見(jiàn)變異的假設(shè)下，利用非參數(shù)廣義Kendall'sΤ的方法構(gòu)造了新的統(tǒng)計(jì)量U，并進(jìn)一步給出了漸近分布W。用新的統(tǒng)計(jì)方法研

3、究了多性狀與多個(gè)罕見(jiàn)變異位點(diǎn)之間的關(guān)聯(lián)性，給多性狀遺傳數(shù)據(jù)的基因關(guān)聯(lián)檢驗(yàn)提供了一種新的方法，為疾病基因定位問(wèn)題的研究拓寬了新的思路。通過(guò)與已有成熟經(jīng)典方法的比較，從而得出本文提出方法的可行性和有效性。闡述了基于個(gè)體的CAST方法、SUM方法、SKAT方法、SKAT-O方法以及NM-IRV方法，并重點(diǎn)闡述了本文提出的基于核心家庭三人組數(shù)據(jù)的NM-RV-FAM方法。通過(guò)模擬數(shù)據(jù)和真實(shí)COL6A3基因數(shù)據(jù)的應(yīng)用，我們發(fā)現(xiàn)這6種方法的第一類錯(cuò)誤