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1、mieroRNA(miRNA),即微小RNA,是一類(lèi)長(zhǎng)約22個(gè)核苷酸的小分子非編碼RNA,通常與靶基因mRNA的3'UTR發(fā)生不完全互補(bǔ),在轉(zhuǎn)錄后水平調(diào)節(jié)基因的表達(dá)。自2000年首次報(bào)道以來(lái),對(duì)microRNA的研究進(jìn)展迅速,全世界有很多研究小組致力于研究microRNA在各個(gè)物種間的分布情況和它所發(fā)揮的重要作用。近幾年的研究表明,這是一種高度保守的、廣泛存在于植物、動(dòng)物、病毒中的調(diào)節(jié)機(jī)制,在生長(zhǎng)發(fā)育、器官的形成、癌癥的發(fā)生和病毒感染等
2、過(guò)程中扮演重要的角色。microRNA的發(fā)現(xiàn)是對(duì)經(jīng)典的遺傳學(xué)法則的重要補(bǔ)充。 HSV-I(herpes simplex virus 1)是一個(gè)有包膜的雙鏈DNA病毒,具有龐大的基因組,目前已知的編碼蛋白有84個(gè),分為α、β、γ三類(lèi),基因表達(dá)的調(diào)控極為復(fù)雜,很多基因的功能以及調(diào)控過(guò)程仍不清楚。HSV-I在原發(fā)感染之后不能被宿主免疫系統(tǒng)徹底清除,會(huì)終生潛伏在宿主的神經(jīng)節(jié)細(xì)胞內(nèi),一定狀態(tài)下被重新激活,對(duì)機(jī)體造成損傷。目前的研究結(jié)果仍不
3、能很好地解釋這種特殊的感染.潛伏.再激活的感染過(guò)程。 本課題的目的是預(yù)測(cè)并驗(yàn)證HSV-I基因組中新的microRNA,進(jìn)而研究它在HSV-I基因表達(dá)調(diào)控中的作用。利用生物信息學(xué)的方法,依據(jù)一定的條件,我們確定了HSV-I基因組中可能編碼microRNA的27個(gè)莖環(huán)結(jié)構(gòu),其中有4個(gè)在mieroRNA序列比對(duì)和預(yù)測(cè)軟件miRBase::Sequences中顯示出較高的得分且在Herpes病毒家族中較為保守。提取HSV-I感染的細(xì)胞s
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