皮膚擴(kuò)張?jiān)缙趍iRNA和mRNA的變化及關(guān)鍵miRNA篩選.pdf_第1頁
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文檔簡(jiǎn)介

1、目的：建立皮膚擴(kuò)張模型，探究皮膚擴(kuò)張?jiān)缙谥衜iRNA和mRNA表達(dá)譜的變化情況。
　　方法：取6-8周SD大鼠建立擴(kuò)張模型，在擴(kuò)張?jiān)缙谌∠聰U(kuò)張皮膚，并利用未擴(kuò)張皮膚作為對(duì)照，采用Affymetrix microRNA3.0平臺(tái)和Affymetrix GeneChip Rat Gene1.0 ST檢測(cè)擴(kuò)張?jiān)缙趍iRNA和mRNA的表達(dá)變化；利用統(tǒng)計(jì)學(xué)方法初步篩選出表達(dá)發(fā)生變化的miRNA和mRNA，并根據(jù)差異表達(dá)的倍數(shù)篩選出表達(dá)差異

2、較大的關(guān)鍵miRNA。采用TargetScan、miRDB和IPA數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)關(guān)鍵miRNA進(jìn)行靶點(diǎn)預(yù)測(cè)；利用miRNA與靶點(diǎn)mRNA數(shù)量變化呈負(fù)相關(guān)的關(guān)系初步明確擴(kuò)張?jiān)缙趍iRNA可能調(diào)控的mRNA靶點(diǎn)，建立miRNA-靶mRNA的一一對(duì)應(yīng)關(guān)系。對(duì)靶點(diǎn)mRNA進(jìn)行功能分析和通路分析，明確擴(kuò)張?jiān)缙陉P(guān)鍵miRNA-靶mRNA-通路的對(duì)應(yīng)關(guān)系。
　　結(jié)果：篩選出了11個(gè)滿足統(tǒng)計(jì)學(xué)差異和表達(dá)倍數(shù)變化的miRNA，明確了miRNA-靶mRNA

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