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文檔簡介
1、目的:
1.在全國各地收集視神經(jīng)萎縮家系,然后建立臨床、家系資料以及分子遺傳學(xué)資料數(shù)據(jù)庫。
2.在收集的視神經(jīng)萎縮家系及正常對照中篩查與Leber遺傳性視神經(jīng)病變(LHON)相關(guān)的線粒體DNA(mtDNA)三個原發(fā)突變位點(ND1/G3460A、ND4/G11778A、ND6/T14484C),繪制中國LHON人群的突變頻譜。
3.對其中兩個具有典型臨床表現(xiàn)和家族史并同時攜帶有原發(fā)突變位點及T3
2、394C突變的LHON家系先證者進行線粒體DNA(mtDNA)全基因組進行研究分析。
4.進一步分析ND1基因T3394C突變對LHON發(fā)病的分子機制,為LHON的診療提供新的依據(jù)。
材料與方法:
1.通過與北京中醫(yī)藥大學(xué)東方眼科醫(yī)院、中國中醫(yī)科學(xué)院眼科醫(yī)院、河北省邢臺市眼科醫(yī)院和溫州醫(yī)學(xué)院附屬眼視光醫(yī)院合作,以及全國其它醫(yī)院送來的家系,構(gòu)建視神經(jīng)萎縮家系的各地收集網(wǎng)絡(luò)。經(jīng)所有受試者同意和溫州醫(yī)
3、學(xué)院倫理道德委員會的許可,簽署知情同意書后,最后采集外周靜脈(肘靜脈)血樣3~5mL,并收集詳細(xì)的臨床和家系資料(其中包括用Cyrillic軟件繪家系圖)。
2.對受試對象(包括患者和正常對照)進行詳細(xì)具體的眼科臨床檢查,包括檢測視力(應(yīng)用標(biāo)準(zhǔn)國際對數(shù)視力表),色覺檢查(應(yīng)用俞自萍色覺圖),視野檢查(應(yīng)用Humphrey視野計),VEP(應(yīng)用德國羅蘭電生理儀)以及眼底彩照(應(yīng)用佳能眼底數(shù)碼彩照)。
3.用經(jīng)典
4、的酚-氯仿抽提法或DNA提取試劑盒法提取全基因組DNA(包含mtDNA)并以其作為PCR擴增模板,對先證者及家系母系成員原發(fā)突變G11778A、G3460A和T14484C所在的3個片段進行PCR擴增,對PCR產(chǎn)物進行純化后,最后應(yīng)用自動測序儀進行測序。
4.對兩個同時攜帶有T3394C突變和原發(fā)突變位點的LHON家系先證者進行進一步的眼科臨床檢查,詳細(xì)詢問家族史并記錄。然后使用設(shè)計好的24對引物對其進行線粒體全基因擴增、
5、純化和測序。
5.使用生物軟件(包括DNAStar5.0、Chromas2.24、Clustal X1.83等)對測序結(jié)果與劍橋序列(NC_012920)進行比對分析,確定線粒體基因變異位點及其單體型,分析ND1 T3394C對LHON發(fā)病的影響。
6.根據(jù)Genbank選取17種不同進化物種如:人(Homo sapiens)、牛(Bostaurus)、鼠(Musmusculus)、非洲爪蟾(Xenopus
6、laevis)等不同物種對線粒體序列進行種系發(fā)生學(xué)分析。
7.同樣,收集116例正常對照(僅限漢族人群)根據(jù)上述所述方法抽取3~5mL外周靜脈血后進行線粒體基因分析。
結(jié)果:
1.自2004年以來,到2012年12月,本課題組已收集了1218個視神經(jīng)萎縮家系,其中攜帶LHON三個原發(fā)突變位點的家系504個,包括429個G11778A突變家系、16個G3460A突變家系、59個T14484C突變家
7、系。
2.這兩個家系表現(xiàn)有典型的LHON臨床癥狀和遺傳學(xué)特點,家系母系成員分別為17位和13位,外顯率分別為24%和46%。
3.對家系進行mtDNA全序列測序分析發(fā)現(xiàn)其攜帶原發(fā)突變外,還有其它堿基突變,mtDNA單體型均屬于東亞單體型M9a。在這所有的突變中有很有意義的ND1亞基上高度保守的T3394C突變。
4.在116例正常對照中發(fā)現(xiàn)4例攜帶有T3394C突變。
結(jié)論:
8、> 1.三個原發(fā)突變位點存在中國LHON患者中,但并不是每個攜帶者均出現(xiàn)LHON癥狀。中國LHON人群中,T14484C突變頻率和白種人接近,G3460A突變的頻率明顯低于白種人,但是G11778A突變頻率則明顯高于白種人。
2.這兩個家系具有典型的LHON臨床表現(xiàn)和家族遺傳特點,而且外顯率較高,G11778A和T14484C分別是其主要的致病因素。
3.3394位于ND1第30位保守性位置,其突變使得
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