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文檔簡介
1、分子動力學(xué)作為從理論上研究復(fù)雜分子體系的最直接方法之一,特別適合用來模擬蛋白質(zhì)與材料表面相互作用體系。本文使用分子動力學(xué)軟件Discovery Studio2.1,在隱性溶劑環(huán)境下,以凝血十二因子九肽片段、纖維蛋白原片段作為研究對象,對蛋白質(zhì)(片段)與不同類型親水性結(jié)構(gòu)修飾的聚氨酯材料表面相互作用體系進行分子動力學(xué)模擬。同時,將單獨蛋白質(zhì)(片段)體系的分子動力學(xué)模擬作為蛋白質(zhì)(片段)的自然狀態(tài),供其他蛋白質(zhì)(片段)與材料表面相互作用體系
2、進行對比。通過比較相關(guān)參數(shù)(如二面角分布、均方根偏移等),得出材料表面組成、結(jié)構(gòu)與被吸附蛋白質(zhì)的構(gòu)象變化的關(guān)系,從而驗證“維持自然狀態(tài)說”的合理性,為新型抗凝血高分子材料的設(shè)計、材料制備過程中工藝方法的選擇和加工工藝參數(shù)的控制提供理論依據(jù)。
本文從分子水平上提供蛋白質(zhì)(片段)與材料表面相互作用的細節(jié),研究不同材料表面對蛋白質(zhì)(片段)自然狀態(tài)造成的影響。對上述不同體系進行分子動力學(xué)模擬的結(jié)果顯示,甲基丙烯酸羥乙酯(HEMA)
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