食肉目TLR1，2和4基因的分子進化初步研究.pdf

1、四川農業(yè)大學SichuanAgriculturalUniversityDissertationfortheDegreeofMasterofScienceinAgricultureEvolutionaryanalysisofTLR1，2and4inorderCarnivoraWeiLiuDirectedbyProLHuailiangXuYa’a_qSichuan625014PRChinaEmail：wlyml27@gmailcornATh

2、esisSubmittedtOtheSichuanAgriculturalUniversityinPartialFulfillmentoftheRequirementsfortheDegreeofMasterofScienceinAgriculture四JIf農業(yè)大學碩士畢業(yè)論文摘要在脊椎動物進化過程中，適應性免疫的獲得往往會造成天然免疫相關基因受到的選擇壓力的改變。在果蠅的不同物種間，模式識別受體相關的基因比其他天然免疫基因表現(xiàn)出了更

3、多適應性進化。因此，探宄先天性免疫相關基因在脊椎動物中的進化動力學將有利于更深入地理解物種進化過程中抗病和適應環(huán)境的機理；食性不同的動物，其腸道微生物菌群存在顯著的差異，然而腸道微生物會對宿主機體的免疫能力有明顯的調控作用，因此，脊椎動物腸道菌群會對天然免疫相關基因受到的選擇壓力有所“調控”嗎通過引入數(shù)學模型，以及模型的改進，分子進化的方法在近年來已發(fā)展成為一個在檢測適應性進化方面強有力的方法，其靈敏度和計算速度得到了巨大的發(fā)展。食肉目

4、動物是脊椎動物中的一個大類群，其中的大熊貓和小熊貓“退化”為典型的“素食主義者”，為研究上面的兩個假設提供有利的優(yōu)勢?；谇懊娴膬蓚€假設，本研究利用PCR產物直接測序的成熟生物學技術，基于最大似然法研究天然免疫相關基因TLRl，2和4在食肉目動物中的進化動力學和食性對其進化動力學的影響，獲得的主要結果如下：1)獲得了4個物種的TLRl基因序列，其中豬獾和東北虎為完整編碼區(qū)序列，其長度為2370bp，而黑熊和黃鼬的為部分編碼區(qū)序列，長度為

5、2229bp；獲得了7個物種的TLR2基因完整編碼區(qū)序列，包括東北虎，黑熊，豹貓，果子貍，黃鼬，鼬獾，豬獾，其全長為2358bp；測得了9個物種的TLR4基因編碼區(qū)序列，包括小熊貓，豬獾，鼬獾，黃鼬，果子貍，東北虎，豹貓，斑林貍，黑熊，其全長為2502bp；3個目的基因在食肉目中的同源性分析結果顯示每個基因的核苷酸序列和氨基酸序列都比較保守，相似性均在80％以上；SMART預測結構功能域揭示3個蛋白的大致結構相差不大，主要區(qū)別在于胞外區(qū)