半滑舌鰨(Cynoglossus semilaevis)R-spondin1和R-spondin3基因的克隆與表達分析.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、半滑舌鰨(Cynoglossus semilaevis)是我國極其重要的海洋養(yǎng)殖經(jīng)濟魚類,雌雄個體差異較大。R-spondin(Rspo)蛋白家族共有4位成員,Rspo1-4,為分泌性蛋白。Rspo蛋白家族成員含有相似度很高的保守結(jié)構(gòu)域:2個富含半胱氨酸的furin-like結(jié)構(gòu)功能域(furin-like cysteine rich domain,F(xiàn)U)和1個血小板反應蛋白結(jié)構(gòu)域(thrombospondin-type1 domain

2、,TSP1)。已知所有的成員蛋白均能與Wnt信號通路相互作用,在脊椎動物發(fā)育過程中發(fā)揮著不同的功能。Rspo1基因作為一個卵巢決定和分化的最佳候選基因,在性別決定、皮膚分化和惡性腫瘤等方面都具有重要的功能。Rspo3基因能調(diào)控造血干細胞命運、促進血管生成、調(diào)控哺乳動物胎盤發(fā)育等等。本實驗主要是通過同源克隆技術(shù)和RACE PCR技術(shù)(Rapid amplification of cDNA ends PCR)分離出半滑舌鰨Rspo1基因和R

3、spo3基因的cDNA全長,利用原位雜交和熒光定量PCR對其基因表達進行了研究,結(jié)合所得到的結(jié)果通過生物信息學分析,對這2個基因的功能進行了預測。具體總結(jié)如下:
  (1)半滑舌鰨Rspo1基因的克隆和表達分析
  利用同源比對得到的簡并引物和RACE引物,克隆分離出半滑舌鰨Rspo1基因ORF全長為834 bp,編碼277個氨基酸,分子量大小約為30.52 kDa。蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預測其含有FU1、FU2、TSP1結(jié)構(gòu)域,分別位

4、于31-86、93-137和154-216處,蛋白比對結(jié)果表明半滑舌鰨Rspo1基因氨基酸序列與其他物種尤其是海洋魚類的Rspo1基因氨基酸序列相似度比較高,系統(tǒng)進化樹的分析也驗證了上述結(jié)果。進化樹明顯的分為兩大枝:魚類該基因分化較大,物種間相似度只有40%-60%,而四足類動物中達到了99%以上。分析預測啟動子區(qū)的轉(zhuǎn)錄因子,發(fā)現(xiàn)存在性別相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子Sox-5,SRY的結(jié)合位點,這對研究該基因功能提供了幫助。實時熒光定量PCR(qRT-

5、PCR)結(jié)果表明半滑舌鰨Rspo1基因在胚胎時期的表達主要是從克氏泡時期之后開始明顯升高。鑒于其在性別分化中的作用,我們比較了該基因在雌雄組織中的差異表達,發(fā)現(xiàn)雌雄各組織中均有表達,其中卵巢中的Rspo1基因表達量顯著高于精巢,是精巢表達量的2倍,這與先前的報道結(jié)果相一致,暗示了Rspo1基因在性別決定中的重要作用;非性腺組織如腦、心等也有表達但雌雄表達差異很小。性腺組織切片原位雜交結(jié)果顯示Rspo1基因主要定位在半滑舌鰨卵巢的卵母細胞

6、的細胞核以及精巢的精原細胞和精母細胞中,精細胞中無信號,這與斑馬魚中Rspo1基因的研究結(jié)果相一致。相同濃度探針雜交后卵巢中的信號要比精巢中的強,也間接說明Rspo1基因在卵巢中的表達量高于精巢。借助斑馬魚這個模式生物,我們探究了體外注射半滑舌鰨Rspo1基因?qū)τ诎唏R魚發(fā)育以及Wnt信號通路的影響。注射半滑舌鰨Rspo1-GFP質(zhì)粒后綠色熒光信號可出現(xiàn)在身體的大多數(shù)位置,同時導致胚胎畸形率升高;當在胚胎中過量表達半滑舌鰨Rspo1基因和

7、Wnt3a基因mRNA后,Wnt信號通路受到了抑制。
  (2)半滑舌鰨Rspo3基因的克隆和表達分析
  同樣通過同源克隆和RACE技術(shù),分離出半滑舌鰨Rspo3基因ORF全長共987 bp,編碼328個氨基酸,分子量大小約為38.07 kDa。蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預測該基因除了含有FU1(36-88)、FU2(94-137)、TSP1(200-257)保守結(jié)構(gòu)域外,還含有1個FU3(141-185)結(jié)構(gòu)域。經(jīng)比對分析后發(fā)現(xiàn),3個F

8、U保守結(jié)構(gòu)域是魚類Rspo3基因所特有的,哺乳動物如人類和小鼠Rspo3基因就不存在這種現(xiàn)象。系統(tǒng)進化樹中Rspo3基因聚為兩大類:魚類和哺乳類,而且魚類中明顯分為海水魚和淡水魚,進化關(guān)系更為明確。qRT-PCR結(jié)果顯示出半滑舌鰨Rspo3基因在成魚各組織中均有表達,尤其以腦和鰓組織表達量最高。體外注射半滑舌鰨Rspo3-GFP質(zhì)粒對于斑馬魚發(fā)育具有顯著的影響,正常發(fā)育的胚胎熒光信號少而集中于肌肉中,畸形胚胎出現(xiàn)尾部蜷曲、縮短,頭部發(fā)育

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