人類外周血單核細(xì)胞蛋白質(zhì)組學(xué)研究.pdf

1、蛋白質(zhì)作為基因表達(dá)的產(chǎn)物，生命活動(dòng)的體現(xiàn)者及功能最終執(zhí)行者，在生物體內(nèi)有著及其重要的作用。隨著后基因組時(shí)代的推進(jìn)，蛋白質(zhì)組學(xué)的研究逐漸成為近期生物科學(xué)研究的中心之一。蛋白質(zhì)組學(xué)的研究不僅能揭示生命活動(dòng)的基本規(guī)律，也為許多復(fù)雜疾病的發(fā)病機(jī)理及攻克措施提供了理論依據(jù)。系統(tǒng)而全面性的蛋白質(zhì)組學(xué)研究的主要任務(wù)是鑒定和編目在人體某一類細(xì)胞或組織中產(chǎn)生的所有蛋白質(zhì)，然后利用生物信息學(xué)的處理方法，例如：實(shí)驗(yàn)獲得的蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)與已建立的數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行匹配，蛋

2、白質(zhì)功能及細(xì)胞內(nèi)分布位點(diǎn)的歸類和分析，與蛋白質(zhì)相對(duì)應(yīng)的基因功能的注釋(如：基因本體論分析)等，進(jìn)一步來闡述它們的生物學(xué)和細(xì)胞學(xué)功能，進(jìn)而幫助更有效的進(jìn)行某些相關(guān)疾病的診斷和治療。系統(tǒng)而全面的呈現(xiàn)蛋白質(zhì)及其相對(duì)應(yīng)的基因的信息主要包括以下內(nèi)容：蛋白質(zhì)的鑒定、定位以及定量分析，蛋白質(zhì)所對(duì)應(yīng)的基因的功能注釋、歸類等。本研究是針對(duì)人類外周血單核細(xì)胞(PBM)的蛋白質(zhì)組學(xué)研究。人類外周血單核細(xì)胞(PBM)是一種特殊的白細(xì)胞，同時(shí)也是破骨細(xì)胞的前體，

3、它在免疫、血液、骨骼、腫瘤等相關(guān)的生理過程中扮演者重要的角色。它涉及到許多人類復(fù)雜疾病的生理或病理過程，例如：自身免疫缺陷，HIV，癌癥，骨質(zhì)疏松等。到目前為止，關(guān)于人類PBM的蛋白質(zhì)組學(xué)的研究還十分有限，在蛋白質(zhì)水平上揭示許多與PBM相關(guān)疾病的發(fā)病機(jī)理仍有一定的困難，到目前為止，尚未有一個(gè)系統(tǒng)編目人類PBM中蛋白質(zhì)的數(shù)據(jù)庫(kù)確立。
　　 本研究中基于76個(gè)隨機(jī)的不相干的高加索人群，利用現(xiàn)代蛋白質(zhì)組學(xué)研究的最新技術(shù)即液相色譜.質(zhì)譜

4、聯(lián)用技術(shù)，獲得76個(gè)獨(dú)立、有效的PBM蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)，我們建立第一個(gè)關(guān)于人類PBM的蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)。這個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)包含了以下信息：鑒定了在PBM中表達(dá)的蛋白，這些蛋白的含量以及它們的生化指數(shù)(分子量和等電點(diǎn))，這些蛋白質(zhì)的功能(包括細(xì)胞器的定位，分子功能及參與的生物學(xué)過程)。本研究總共鑒定了2413種在PBM中表達(dá)的蛋白。所有這些蛋白對(duì)應(yīng)的基因通過基因本體論(GeneOntology)的分析分別進(jìn)行了注釋和分類?；虮倔w論的術(shù)語(yǔ)主要分為三

5、個(gè)方面：生化過程、細(xì)胞組成、分子功能。這些基因被分類到相應(yīng)的基因本體論術(shù)語(yǔ)中。通過這些注釋，能直觀清晰的呈現(xiàn)基因及其表達(dá)產(chǎn)物蛋白質(zhì)與機(jī)體生理、生化過程之間關(guān)系。在這些注釋中，一些熟知的基因被報(bào)道與人類的免疫反應(yīng)、血液相關(guān)生理、骨重建、癌癥等密切相關(guān)。
　　 總之，本研究為人類PBM建立了一個(gè)全新的蛋白質(zhì)組學(xué)的數(shù)據(jù)庫(kù)，這個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)包含著相對(duì)全面而豐富的信息，從整體水平上加深了我們對(duì)人類PBM生物學(xué)功能的理解。作為第一個(gè)針對(duì)PBM的蛋