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文檔簡介
1、目的:
腸道病毒71型(EV71)屬微小RNA病毒科腸道病毒屬A組,是引起手足口病的主要病原體之一。MicroRNA(miRNA)是一類內(nèi)生的、長度約20-24個核苷酸的單鏈非編碼小分子 RNA,miRNA不編碼蛋白,而是通過與mRNA的3'端非編碼區(qū)或編碼區(qū)的結(jié)合位點結(jié)合,降解或者抑制mRNA的翻譯來抑制基因的表達。在EV71感染神經(jīng)母細胞瘤細胞(SK-N-SH)miRNA差異表達譜的實驗基礎(chǔ)上,利用miRNA(模擬體)mi
2、mic和 miRNA(抑制體)inhibitor篩選并驗證了對EV71有調(diào)控作用的miRNA-155(miR-155),并進一步闡明了miR-155通過靶向PICALM抑制EV71在神經(jīng)細胞中的復(fù)制。
方法:
?。?)收集感染EV71前后的SK-N-SH神經(jīng)細胞,提取總RNA,利用miRNA芯片得出EV71感染SK-N-SH前后差異miRNA表達譜,篩選EV71感染SK-N-SH前后顯著差異的miRNA;并利用實時熒光
3、定量RT-PCR(QRT-PCR)驗證芯片結(jié)果。
(2)利用miRNA mimic和 miRNA inhibitor轉(zhuǎn)染SK-N-SH神經(jīng)細胞,改變miRNA水平,利用細胞病變效應(yīng)(CPE)觀察、病毒滴度TCID50測定、QRT-PCR、Western blotting(WB)等方法,與陰性對照組和空白對照組比較EV71病毒復(fù)制的變化,驗證miRNA對EV71在SK-N-SH神經(jīng)細胞中復(fù)制的調(diào)控作用。
?。?)利用mi
4、RNA的靶基因數(shù)據(jù)庫miRanda,TargetScan和miRbase,篩選miRNA的靶基因,雙熒光素報告酶法驗證miRNA的靶基因。利用靶基因的過表達載體和小干擾RNA(si-RNA)分別上調(diào)和下調(diào)靶基因的表達后,觀察miRNA對EV71調(diào)控作用的變化,驗證miRNA通過靶向基因調(diào)控EV71在神經(jīng)細胞中的復(fù)制。
結(jié)果:
?。?)在EV71感染SK-N-SH神經(jīng)細胞后,miRNA芯片和qRT-PCR結(jié)果均顯示miR
5、NA-155的表達水平顯著上升,且miR-155的上升與EV71病毒的感染量、感染時間均呈正相關(guān)。
?。?)miRNA-155 mimic轉(zhuǎn)染SK-N-SH神經(jīng)細胞后,miR-155水平顯著上升,與陰性對照相比,EV71在SK-N-SH神經(jīng)細胞中的復(fù)制被抑制。同時,miR-155對EV71病毒復(fù)制的抑制作用與miR-155的表達水平呈正相關(guān)。
(3)利用miRBase等生物學(xué)軟件并結(jié)合基因功能,篩選出miR-155的候
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