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文檔簡(jiǎn)介
1、目的:
腫瘤(tumor)是生物機(jī)體在各種生物、理化等各種致瘤因素的作用下,組織中的某單一細(xì)胞在遺傳學(xué)或表觀遺傳學(xué)水平上失去對(duì)其生長(zhǎng)的正常調(diào)控,進(jìn)而導(dǎo)致單細(xì)胞克隆性異常增生而產(chǎn)生的新生物。腫瘤常分為良性和惡性兩大類,通常所謂的“癌癥”是生物體內(nèi)所有的惡性腫瘤的統(tǒng)稱。
微小RNA(microRNA)是一類長(zhǎng)度為19~25個(gè)核苷酸的內(nèi)源性小分子非編碼RNA,在眾多生物學(xué)過程中發(fā)揮重要的調(diào)節(jié)功能,例如胚胎發(fā)育、組織器官形成
2、、病毒防御、細(xì)胞增殖和腫瘤發(fā)生發(fā)展等。miRNA可以通過與靶基因mRNA3'-UTR的特定位點(diǎn)結(jié)合,遏制其翻譯過程或誘導(dǎo)其降解,從而參與基因的表達(dá)調(diào)控。miRNA可參與腫瘤相關(guān)的多種信號(hào)通路,與腫瘤的產(chǎn)生、增值、侵襲、轉(zhuǎn)移等過程密切相關(guān)。目前,諸多文獻(xiàn)報(bào)道乳腺癌中多種miRNAs表達(dá)異常,例如miR-200、let-7和miR-10b。因此,進(jìn)一步研究miRNA在乳腺癌中的表達(dá)水平及其功能有利于我們更好的理解乳腺癌發(fā)生發(fā)展的分子機(jī)制,并
3、力求找到能有效防控腫瘤發(fā)生發(fā)展的新策略。
Six1首先在果蠅體內(nèi)發(fā)現(xiàn),作為Six家族成員之一,發(fā)揮著類似于其家族成員所擁有的廣泛而又強(qiáng)大的作用。目前為止,Six1的研究對(duì)理解腫瘤發(fā)生發(fā)展機(jī)制具有重要意義,同時(shí)為腫瘤診斷及治療提供潛在的的靶點(diǎn)。
本課題首先利用生物信息學(xué)技術(shù),同時(shí)使用三種在線生物信息學(xué)軟件TargetScan,mirDIP及miRDB協(xié)同篩查,篩選出miR-204-5p潛在的下游靶基因,并綜合挑選評(píng)分?jǐn)?shù)
4、較高的100個(gè)潛在靶點(diǎn),剔除已有研究報(bào)道證實(shí)的靶點(diǎn),進(jìn)一步利用雙熒光素酶及免疫印跡實(shí)驗(yàn)等技術(shù)對(duì)挑選的的靶基因進(jìn)行驗(yàn)證。并結(jié)合臨床標(biāo)本,利用原位雜交技術(shù)檢測(cè)miR-204-5p在乳腺癌組織中的表達(dá)水平,同時(shí)通過免疫組化實(shí)驗(yàn)技術(shù)檢測(cè)相應(yīng)靶基因在相同乳腺癌組織中的表達(dá)水平。其次通過體外細(xì)胞功能實(shí)驗(yàn)來研究miR-204-5p對(duì)乳腺癌細(xì)胞增值、遷移及侵襲等多種生物學(xué)行為的影響。由于Six1具有轉(zhuǎn)錄因子功能,本實(shí)驗(yàn)進(jìn)一步通過實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)其
5、可能對(duì)miR-204-5p及相關(guān)基因表達(dá)水平的影響,以期闡明其在乳腺癌中發(fā)揮作用的分子機(jī)制。本課題的研究成果將進(jìn)一步加深我們對(duì)乳腺癌發(fā)生發(fā)展機(jī)制的了解,為乳腺癌的早期診斷及治療提供新的策略,或可以為此疾病的新藥研發(fā)提供關(guān)鍵的分子靶點(diǎn)。
方法:
1.miR-204-5p下游靶基因的預(yù)測(cè)及對(duì)靶基因Six1調(diào)節(jié)作用的研究
通過miRNA靶基因預(yù)測(cè)網(wǎng)站包括TargetScan、mirDIP、miRBase對(duì)miR-
6、204-5p可能的作用靶點(diǎn)進(jìn)行預(yù)測(cè)。2.以MCF-7細(xì)胞總RNA為模板,擴(kuò)增基因Six1 mRNA3'-UTR序列,連接psiCHECKTM-2載體,構(gòu)建psiCHECKTM--Six1-3-UTR野生型熒光素酶重組質(zhì)粒。3.以psiCHECKTM-2-Six1-3'-UTR重組質(zhì)粒為模板,進(jìn)行亞克隆。采用SOE的方法,擴(kuò)增Six1-3'-UTR突變型重組質(zhì)粒,包括psiCHECKTM-2-Six1-3'-UTR-Mut-1+Mut-2
7、、psiCHECKTM-2-Six1-3'-TR-Mut-1、psiCHECKTM-2-Six1-3'-UTR-Mut-2。4.采用雙熒光素酶報(bào)告基因檢測(cè)系統(tǒng)對(duì)靶基因的確認(rèn)。設(shè)計(jì)miR-204-5p mimic組、mimic NC組進(jìn)行實(shí)驗(yàn),分別轉(zhuǎn)染293T、MCF-7、MDA-MB-231細(xì)胞,48h后收集各組熒光信號(hào),實(shí)驗(yàn)采用One-WayANOVA統(tǒng)計(jì)方法進(jìn)行分析。
2.miR-204-5p及Six1在乳腺癌中的表達(dá)及意
8、義
收集30例乳腺癌新鮮臨床標(biāo)本,分別采用原位雜交技術(shù)(in situ hybridization,ISH)和免疫組織化學(xué)技術(shù)(immunohistochemistry,IHC)檢測(cè)miR-204-5p和Six1在相同連續(xù)乳腺癌組織切片中的表達(dá)水平,并分析兩者表達(dá)關(guān)聯(lián)性及獨(dú)立臨床意義。
3.miR-204-5p對(duì)乳腺癌細(xì)胞生物學(xué)功能的影響
(1)實(shí)驗(yàn)分為兩組:MCF-7-NC細(xì)胞組(陰性對(duì)照)、MCF-7-
9、miR-204細(xì)胞組(實(shí)驗(yàn)組)。
(2)MTT實(shí)驗(yàn)檢測(cè)并繪制0h、12h、24h及48h出各組細(xì)胞生長(zhǎng)增殖曲線,評(píng)估m(xù)iR-204-5p對(duì)于MCF-7、MDA-MB-231乳腺癌細(xì)胞增殖能力的影響。
(3)劃痕實(shí)驗(yàn)檢測(cè)MCF-7各組細(xì)胞遷移能力,評(píng)估過表達(dá)miR-204-5p對(duì)MCF-7細(xì)胞遷移能力的影響。
(4)Matrigel-Transwell實(shí)驗(yàn)檢測(cè)并獲取各組乳腺癌細(xì)胞侵襲實(shí)驗(yàn)圖,評(píng)價(jià)miR-204
10、-5p對(duì)MCF-7、MDA-MB-231細(xì)胞侵襲能力的影響。
4.Six1/miR-204-5p反饋調(diào)節(jié)分子機(jī)制的研究
(1)以MCF-7細(xì)胞總RNA為模板,擴(kuò)增基因Six1 mRNA CDs序列并構(gòu)建pcDNA-3.1-Six1重組質(zhì)粒。
(2)分別用NC、Six1-siRNA1,Six1-siRNA2、pcDNA3.0-Six1轉(zhuǎn)染MCF-7細(xì)胞,采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)檢測(cè)轉(zhuǎn)染后各組miR-204-
11、5p的表達(dá)量,并分析其意義。
(3)并且分別用mimics NC、miR-204-5p mimics、siRNA1、siRNA2、Six1+siRNA1、Six1+siRNA2轉(zhuǎn)染MCF-7細(xì)胞株,免疫印跡實(shí)驗(yàn)檢測(cè)Six1及侵襲相關(guān)CDH1(E-cadherin)蛋白表達(dá)水平。
結(jié)果:
1.miR-204-5p下游靶基因的預(yù)測(cè)結(jié)果及對(duì)靶基因Six1調(diào)節(jié)作用的研究結(jié)果
(1)生物信息學(xué)分析:三種在線
12、數(shù)據(jù)庫(kù)TargetScan、miRDIP、miRBase預(yù)測(cè)并篩選出miR-204-5p的靶基因Six1;分析結(jié)果顯示,miR-204-5p與Six13'-UTR存在兩個(gè)7bp互補(bǔ)配對(duì)位點(diǎn)。
(2)雙熒光素酶報(bào)告基因結(jié)果證實(shí)了miR-204-5p可與Six13'-UTR結(jié)合。
(3)免疫印跡實(shí)驗(yàn)檢測(cè)到miR-204-5p下調(diào)Six1蛋白的表達(dá)水平。
(4)Western blot檢測(cè)到不含3'-UTR的外源
13、性Six1 CDs序列重組基因不受miR-204-5p的調(diào)控,并且miR-204-5p對(duì)Six1的抑制作用可通過引入外源性Six1而逆轉(zhuǎn)。
2.miR-204-5p及Six1在乳腺癌中的表達(dá)呈負(fù)相關(guān)
在miR-204-5p高表達(dá)的乳腺癌組織標(biāo)本當(dāng)中,Six1呈現(xiàn)出低表達(dá);而在miR-204-5p低表達(dá)的乳腺癌組織標(biāo)本當(dāng)中,Six1呈現(xiàn)出高表達(dá)。miR-204-5p及Six1在乳腺癌組織中的表達(dá)水平呈現(xiàn)出明顯的負(fù)相關(guān)。
14、
3.miR-204-5p通過靶向調(diào)控Six1抑制乳腺癌細(xì)胞遷移及侵襲,但并不影響其增值能力。
(1)miR-204-5p mimic成功轉(zhuǎn)染MCF-7細(xì)胞后,實(shí)時(shí)熒光定量PCR(Real-time PCR)檢測(cè)MCF-7細(xì)胞miR-204-5p的表達(dá)明顯升高。miRNC成功轉(zhuǎn)染至MCF-7細(xì)胞,轉(zhuǎn)染后陰性對(duì)照組與實(shí)驗(yàn)組相比, MCF-7細(xì)胞中miR-204-5p的表達(dá)明顯降低。
(2)MTT法檢結(jié)果,MC
15、F-7-miR204組與陰性對(duì)照mimic NC相比,采用獨(dú)立樣本t檢驗(yàn)分析轉(zhuǎn)染miR-204-5pmimic對(duì)細(xì)胞增殖的影響,24h T=0.636,P=0.543;48h T=0.842,P=0.424;72h T=1.716, P=0.125; P值均>0.05。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明miR-204-5p表達(dá)水平改變可能對(duì)MCF-7細(xì)胞的增殖無影響,miR-205-5p并非乳腺癌細(xì)胞增殖相關(guān)基因。
(3)劃痕實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示,經(jīng)過24
16、h無血清培養(yǎng)后,與miR-204-5p mimic組相比,轉(zhuǎn)染陰性對(duì)照組的劃痕距離明顯減少,實(shí)驗(yàn)組可見明顯劃痕。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明miR-204-5p過表達(dá)可促進(jìn)MCF-7細(xì)胞遷移。
(4)Matrigel-Transwell實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示,MCF-7細(xì)胞miR-204-5p mimics轉(zhuǎn)染組的遷移能力明顯弱于mimics NC組,MDA-MB-231細(xì)胞miR-204-5p mimics轉(zhuǎn)染組的遷移能力也明顯弱于mimics NC
17、組,實(shí)驗(yàn)結(jié)果通過獨(dú)立樣本t檢驗(yàn),T=15.469, P=0.000,結(jié)果差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
體外實(shí)驗(yàn)表明,外源性過表達(dá)miR-204-5p不能影響乳腺癌細(xì)胞的增值能力,但是外源性過表達(dá)miR-204-5p可明顯抑制乳腺癌細(xì)胞的遷移及侵襲能力,miR-204-5p可作為腫瘤抑制基因。
4.Six1/miR-204-5p形成負(fù)反饋調(diào)控環(huán)路
(1)Six1 siRNA組miR-204-5p表達(dá)量明顯高于NC組及
18、Six1過表達(dá)組,表明Six1可抑制miR-204-5p基因的表達(dá)。
(2)miR-204-5p過表達(dá)組相比較mimic NC組的Six1蛋白表達(dá)量明顯降低,內(nèi)源性miR-204-5p與Six1在乳腺癌中表達(dá)呈顯著負(fù)相關(guān)。
結(jié)論:
可見,Six1在乳腺癌中可抑制miR-204-5p表達(dá)。并且miR-204-5p通過抑制Six1的表達(dá),進(jìn)而上調(diào)CDH1的表達(dá)量,從而抑制乳腺癌細(xì)胞遷移及侵襲。因此,miR-20
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