造血干細(xì)胞移植HLA匹配供者與受者微衛(wèi)星DNA多態(tài)性的相似度評(píng)估.pdf_第1頁(yè)
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1、目的:研究造血干細(xì)胞移植HLA匹配供者與受者的19個(gè)STR位點(diǎn)(CSF1PO、D21S11、D2S1338、D3S1358、D5S818、D6S1043、D7S820、D8S1179、D12S391、D13S317、D16S539、D18S51、D19S433、FGA、Penta D、Penta E、TH01、TPOX、vWA)多態(tài)性的相似度從而評(píng)估造血干細(xì)胞供者是否潛在引發(fā)疾病的風(fēng)險(xiǎn)。
  方法:從大連市血液中心2011至201

2、4年造血干細(xì)胞捐獻(xiàn)者中選取HLA匹配者(HLA-A,HLA-B,HLA-DR完全相同)血樣72對(duì),共144例,為匹配組。選取與匹配組HLA不匹配者(HLA-A,HLA-B,HLA-DR完全不相同)血樣72例,與匹配組72對(duì)血樣分別配對(duì),形成144組不匹配組。HLA檢測(cè)結(jié)果由大連市血液中心提供。提取DNA并利用毛細(xì)管電泳技術(shù)對(duì)19個(gè)特定STR基因座位進(jìn)行檢測(cè),利用熒光標(biāo)記引物對(duì)19個(gè)基因座實(shí)施擴(kuò)增。用FAM來(lái)標(biāo)記D21S11、D5S818

3、、D6S1043D18S51、D19S433,共5個(gè)基因座;用HEX來(lái)標(biāo)記CSF1PO、D3S1358、D7S820、D13S317、D16S539、Penta D,共6個(gè)基因座;用TMR來(lái)標(biāo)記D8S1179、ETPOX、Penta、vWA,共4個(gè)基因座;用CAL Fluor Red610來(lái)標(biāo)記D12S391、D2S1338、FGA、TH01,共4個(gè)基因座。同時(shí)擴(kuò)增樣本中的所有DNA片段,用遺傳分析儀、DNA測(cè)序儀進(jìn)行電泳的分析。采用統(tǒng)

4、計(jì)學(xué)軟件SPSS11.5,分析所得數(shù)據(jù)。利用X2檢驗(yàn)對(duì)STR的位點(diǎn)基因頻率進(jìn)行分析,并計(jì)算匹配組與不匹配組每個(gè)基因座位匹配度的顯著性差異是否存在(P<0.05代表有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義)。利用配對(duì)樣本T檢驗(yàn)計(jì)算匹配組與不匹配組之間STR總體是否存在顯著性差異(P<0.05代表有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義)。
  結(jié)果:經(jīng)X2檢驗(yàn)匹配組基因頻率,D5S818“基因座”P=0.048、TH01“基因座”P=0.015,P<0.05,有顯著性差異。匹配組與不匹配

5、組的基因頻率,D13S317“基因座位”P=0.041、D16S539“基因座位”P=0.028,P<0.05,有顯著性差異。在配對(duì)實(shí)驗(yàn)中匹配組基因座位D19S433、D2S1338、vWA、FGA、D5S818、TH01、CSF1PO、D18S51、D12S391、D16S539、D6S1043、D21S11、D13S317、D7S820配對(duì)比率均高于不匹配組,19個(gè)基因座位STR極端配對(duì)數(shù)明顯高于不匹配組(P=0.006),但如果將

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