基于蛋白組學技術(shù)松屬素對柑橘青霉的抑菌機理研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、黃酮化合物具有多樣的生理活性和潛在的藥用價值,其中C5-OH和C7-OH是重要的抗菌活性基團,研究表明,松屬素能顯著抑制意大利青霉呼吸作用并誘發(fā)細胞程序性死亡,已有呼吸抑制試驗證明線粒體呼吸電子傳遞鏈酶復合物Ⅰ,Ⅳ和Ⅴ活性會直接被松屬素抑制;松屬素抑制青霉的關(guān)鍵部位,可能處于線粒體呼吸鏈上,進而導致細胞能量代謝障礙,誘發(fā)細胞凋亡或程序性壞死。本文以柑橘青霉病的主要病原菌意大利青霉為指示菌,使用被證明抗菌活性最強的5,7二羥基黃酮類化合物

2、松屬素,借助蛋白組學IRAQ技術(shù),來研究松屬素不同時間處理后,引起的意大利青霉蛋白表達差異,以及通過分子模擬作為參考,呼吸鏈復合物作為靶點的可能機制,及松屬素引起程序性死亡的探究。
  主要研究結(jié)果如下:
  1.松屬素處理后,意大利青霉的氧化磷酸化通路、TCA循環(huán)產(chǎn)生多種1.2倍以上表達差異的蛋白,其中線粒體呼吸鏈酶復合物Ⅰ,Ⅳ和Ⅴ,及呼吸相關(guān)酶琥珀酸脫氫酶和蘋果酸脫氫酶產(chǎn)生顯著差異,導致導致菌體能量代謝紊亂;程序性死亡過

3、程中某些指示蛋白,比如Apoptosis-inducing factor、凋亡BAX inhibitor蛋白、肽酰脯氨基順反異構(gòu)化的酶(CYPA)等表達產(chǎn)生顯著變化;另外,應(yīng)激狀態(tài)下誘導表達的伴侶蛋白HSP70,其在維持蛋白質(zhì)構(gòu)象上具有多種作用,經(jīng)過松屬素處理后,產(chǎn)生了1.4倍以上的異常表達。
  2.通過計算機輔助設(shè)計軟件MOE,對呼吸鏈蛋白同源建模,然后通過與松屬素分子對接實驗,探究酶復合物與松屬素對接的可能性,以此作為呼吸鏈

4、酶復合物作為靶蛋白的佐證。經(jīng)過同源建模與分子對接后,發(fā)現(xiàn)具有與松屬素結(jié)合的可能性蛋白全部集中在線粒體呼吸鏈蛋白復合物Ⅰ和蛋白復合物Ⅴ,其中得分最高的Unigene2720_CK_0A屬于復合物Ⅴ,松屬素與受體Unigene2720_CK_0A結(jié)合腔形成多個氫鍵相互作用,A環(huán)5位羥基和結(jié)合腔88位Tyr殘基形成氫鍵;C環(huán)羰基與82位Ala殘基形成氫鍵;除此之外,參與配體相互作用的殘基還包括78位Glu、77位Glu、73位Pro、75位S

5、er、74位Lys、79位Ala、81位Leu、80位Asn、96位Glu、95Val、97位GLy、98位Gln、25位Val等。
  3.利用MRM技術(shù)對目標蛋白的進行特異性選擇,驗證差異蛋白的表達變化,結(jié)果顯示,鑒定出的復合物Ⅰ、Ⅱ、Ⅳ、Ⅴ中的多個肽段,在表達趨勢上與原ITRAQ結(jié)果一致,在表達量的差異上表現(xiàn)更為顯著;采用qPCR驗證目標蛋白是否在轉(zhuǎn)錄水平存在差異,結(jié)果表明復合物Ⅰ、Ⅱ、Ⅳ、Ⅴ在mRNA的表達水平與蛋白最終表

6、達情況上并不一致,僅有Unigene2707_CK_0A、Unigene14205_CK_0A(復合物Ⅴ)是在mRNA表達差異與蛋白表達差異上完全一致。
  4.使用Z-VAD-FMK和Necrostatin-1結(jié)合依文思藍染色判斷細胞程序性死亡方式,其中Z-VAD-FMK是一種pan-caspase抑制劑(泛硫胱胺酸蛋白酶抑制劑),Necrostatin-1是RIP1特異性的抑制劑,結(jié)果顯示通過抑制pan-caspase,沒有產(chǎn)

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