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文檔簡(jiǎn)介
1、二氯甲烷(Dichloromethane,簡(jiǎn)稱(chēng)DCM)作為重要的醫(yī)藥化工中間體和有機(jī)溶劑,被廣泛運(yùn)用于工業(yè)生產(chǎn)中。一些未經(jīng)處理的DCM廢氣進(jìn)入大氣和水體得到累積,嚴(yán)重危害到人類(lèi)健康和生態(tài)環(huán)境。傳統(tǒng)微生物降解DCM的時(shí)間較長(zhǎng),過(guò)程極易染菌,不易控制。而本實(shí)驗(yàn)通過(guò)構(gòu)建DCM脫鹵酶工程菌,經(jīng)誘導(dǎo)表達(dá)和提取純化獲得大量DCM脫鹵酶的純酶。由此,利用酶的高效性、專(zhuān)一性、作用條件溫和等特點(diǎn),短時(shí)間迅速達(dá)到降解污染物的效果,作用條件易控。
2、本研究以實(shí)驗(yàn)室前期分離篩選到的1株以DCM為唯一碳源的DCM降解菌—Methylobacterium rhodesianum為供試菌株。以已在NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)公布的Methylobacterium extorquens DM4的DCM脫鹵酶基因作為模板設(shè)計(jì)特異性引物,擴(kuò)增得到M.rhodesianum的DCM脫鹵酶基因序列;將得到的DCM脫鹵酶基因序列提交至NCBI,得到序列登錄號(hào)(access no.KM243642)。利用生物信息學(xué)手
3、段將該序列與M.extorquens DM4的DCM脫鹵酶基因比對(duì),結(jié)果顯示只有一個(gè)堿基的差別,即該序列在62bp處的G代替了M.extorquens DM4的DCM脫鹵酶基因的C。運(yùn)用DNAMAN軟件分析核酸序列的分子量、堿基組成和堿基分布,結(jié)果發(fā)現(xiàn)DCM脫鹵酶核酸序列的堿基組成是A217,C210,G265,T175;百分比為A25.0%,C24.2%,G30.6%,T20.2%;分子量(kDa): ssDNA為269.00,dsD
4、NA為534.55;氨基酸的個(gè)數(shù)為289;蛋白的pI為6.33。蛋白質(zhì)的親水和疏水性分析發(fā)現(xiàn)DCM脫鹵酶的疏水性較強(qiáng),最大值達(dá)到2.2。DCM脫鹵酶的二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)顯示其主要以α-螺旋、不規(guī)則盤(pán)繞和延伸鏈為最大量的結(jié)構(gòu)元件,β-折疊散布于整個(gè)蛋白質(zhì)中。
將DCM脫鹵酶基因克隆至大腸桿菌中表達(dá),提取純化而得到DCM脫鹵酶純酶,DCM脫鹵酶的分子量大小為33 kDa;對(duì)酶活性分析發(fā)現(xiàn)重組E.coli BL21(DE3)中DCM脫鹵酶
5、酶活是出發(fā)菌株M.Rhodesianum的3倍,細(xì)胞內(nèi)外酶活的對(duì)比實(shí)驗(yàn)表明DCM脫鹵酶是胞內(nèi)表達(dá)。它的最適作用溫度是40℃,最適pH是7-8,該酶的Km為10.96mM。DCM脫鹵酶降解DCM的代謝機(jī)理被許多科學(xué)家假設(shè)過(guò),推測(cè)DCM在DCM脫鹵酶的作用下產(chǎn)生HCl和甲醛。然而,這個(gè)假設(shè)只是經(jīng)過(guò)菌體粗酶液初步的推測(cè),目前尚未通過(guò)DCM脫鹵酶純酶降解DCM實(shí)驗(yàn)得到驗(yàn)證。本課題將純化的DCM脫鹵酶用于驗(yàn)證該過(guò)程,實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)顯示DCM脫鹵酶降解D
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