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文檔簡介
1、[目的]篩選與鑒定鼻咽癌細胞中Annexin A1的相互作用蛋白,繪制其在鼻咽癌侵襲轉移中的調(diào)控蛋白質(zhì)分子網(wǎng)絡圖譜,初步了解Annexin A1在鼻咽癌侵襲轉移中的作用與機制。
[方法]收集Annexin A1高表達的低轉移鼻咽癌6-10B細胞總蛋白,采用免疫共沉淀結合凝膠電泳分離 Annexin A1相互作用蛋白,二維液相色譜串聯(lián)質(zhì)譜鑒定相互作用蛋白,并進行基因本體論、功能聚類、信號通路、蛋白-蛋白相互作用等生物信息學分析,
2、繪制Annexin A1在鼻咽癌侵襲轉移中的調(diào)控蛋白質(zhì)分子網(wǎng)絡圖譜。運用免疫共沉淀結合蛋白質(zhì)印跡法對Annexin A1關鍵相互作用組蛋白S100A9、Vimentin進行驗證。
[結果]1、采用免疫共沉淀結合質(zhì)譜分析,在鼻咽癌6-10B細胞中共鑒定了436個Annexin A1相互作用蛋白。2、通過GOTERM_BP分析顯示:Annexin A1相互作用蛋白的生物學過程主要涉及到刺激反應、蛋白定位、細胞代謝過程等;GOTER
3、M_MF分析顯示:Annexin A1相互作用蛋白的分子功能主要涉及到催化作用、陽離子結合功能、蛋白結合功能、核苷酸結合、細胞骨架及 ATP結合功能等;GOTERM_CC分析顯示:Annexin A1相互作用蛋白的定位涉及到細胞質(zhì)、細胞器、細胞膜及細胞骨架等多個部位。3、通過功能聚類分析顯示:Annexin A1相互作用蛋白可聚類成21個功能相關簇,其功能主要涉及到鈣依賴性磷脂結合、信號肽、膜的組分、跨膜轉運、蛋白激酶活性、胞質(zhì)囊泡的組
4、分、細胞骨架組織。4、通過KEGG和Biocarta信號通路分析顯示:Annexin A1相互作用蛋白涉及35條KEGG信號通路和7條Biocarta信號通路,其中有4個蛋白涉及到細胞骨架信號通路,9個蛋白涉及到粘附連接信號通路,12個蛋白涉及到跨膜轉運信號通路。5、通過蛋白-蛋白相互作用網(wǎng)絡分析顯示:S100A9、Vimentin蛋白與Annexin A1形成相互作用組。6、應用免疫共沉淀結合蛋白質(zhì)印跡法證實S100A9、Viment
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