
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文檔簡(jiǎn)介
1、目的:
1.篩選鑒定大腸癌放射敏感性相關(guān)LncRNA及其靶向作用microRNA。
2.初步闡明LncRNA-MALAT1與hsa-miR-1對(duì)大腸癌細(xì)胞放射敏感性的影響機(jī)制。
3.探討LncRNA-MALAT1與hsa-miR-1相互作用機(jī)制。
方法:
1.通過(guò)對(duì)7株大腸癌細(xì)胞進(jìn)行克隆形成實(shí)驗(yàn),挑選出放射抵抗與放射敏感細(xì)胞株,采用二代測(cè)序法篩選放射誘導(dǎo)過(guò)程中差異表達(dá)的LncRNA。對(duì)差
2、異表達(dá)的LncRNA進(jìn)行生物信息學(xué)分析。
2.使用實(shí)時(shí)定量 PCR技術(shù)分別檢測(cè)大腸癌細(xì)胞和大腸癌組織標(biāo)本中LncRNA-MALAT1及hsa-miR-1的表達(dá)量。
3.利用轉(zhuǎn)染技術(shù)分別下調(diào)和上調(diào)大腸癌細(xì)胞中LncRNA-MALAT1和hsa-miR-1表達(dá)并聯(lián)合照射處理后,通過(guò)MTT、生長(zhǎng)克隆、劃痕、凋亡及Western Blot實(shí)驗(yàn)分別檢測(cè)細(xì)胞活力、增殖能力、遷移能力、細(xì)胞凋亡率以及MMP-2、MMP-9、E鈣粘蛋
3、白、Bax和 Bcl-2蛋白表達(dá)。
4.通過(guò)生物信息學(xué)分析,找出LncRNA-MALAT1上hsa-miR-1結(jié)合位點(diǎn),構(gòu)建包含此位點(diǎn)的熒光素酶報(bào)告基因,通過(guò)檢測(cè)熒光素酶報(bào)告基因的活力來(lái)驗(yàn)證兩者的靶向結(jié)合能力,分別調(diào)控細(xì)胞中LncRNA-MALAT1和hsa-miR-1表達(dá)量,進(jìn)一步驗(yàn)證兩者之間的相互調(diào)控作用。
結(jié)果:
1.通過(guò)克隆形成實(shí)驗(yàn),我們?cè)?株大腸癌細(xì)胞中篩選出放射敏感性差異最大的兩株細(xì)胞株,即放射
4、抵抗的CCL244細(xì)胞和放射敏感的HCT116細(xì)胞。
2.二代測(cè)序結(jié)果顯示,照射前后兩株細(xì)胞間均差異表達(dá)的lncRNA有24條(2倍差異以上),通過(guò)生物信息學(xué)分析發(fā)現(xiàn),其中 LncRNA-MALAT1有極強(qiáng)的microRNA結(jié)合能力,hsa-miR-1為其靶向microRNA。
3.隨著照射劑量增加,照射后時(shí)間延長(zhǎng),CCL244細(xì)胞中LncRNA-MALAT1表達(dá)量升高,hsa-miR-1表達(dá)量減少,并呈照射劑量依賴
5、性和時(shí)間依賴性。
4.與癌旁正常大腸組織相比,大腸癌組織中LncRNA-MALAT1表達(dá)量升高(P<0.05),hsa-miR-1表達(dá)量降低(P<0.001)。
5. LncRNA-MALAT1下調(diào)聯(lián)合照射處理組及hsa-miR-1上調(diào)聯(lián)合照射處理組與單純照射處理組相比細(xì)胞活力、細(xì)胞增殖及遷移能力均明顯受到抑制,MMP-2、MMP-9及Bcl-2表達(dá)均降低,E鈣粘蛋白、Bax表達(dá)及細(xì)胞凋亡率均升高。
6.熒
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