EGR1和LAMA2基因多態(tài)性與中國漢族高度近視的關(guān)聯(lián)研究.pdf

1、目的:
　　基于全基因組關(guān)聯(lián)分析及動物模型結(jié)果，選擇早期生長反應(yīng)蛋白1（Early GrowthResponse-1，EGR1）和層粘連蛋白α2（lamininα2，LAMA2）基因作為候選基因，探究其與中國漢族人群高度近視的關(guān)聯(lián)性，為高度近視發(fā)病機(jī)制的揭示奠定基礎(chǔ)。
　　方法:
　　選擇EGR1和LAMA2基因序列中的標(biāo)記位點(diǎn):基于此前的遺傳學(xué)研究及動物實(shí)驗(yàn)?zāi)Ｐ?，選取早期生長反應(yīng)蛋白1（Early Growth Re

2、sponse-1，EGR1）和層粘連蛋白α2（lamininα2，LAMA2）基因作為候選基因。我們在人類單倍型圖譜計(jì)劃（HapMap Project）數(shù)據(jù)庫選取次要等位基因頻率（Minor allele frequency, MAF）＞0.2，r2＞0.8適用于漢族人群的標(biāo)記SNP(tSNP)用作連鎖不平衡分析(Linkagedisequilibrium，LD)由此確定了了EGR1基因標(biāo)記位點(diǎn)rs11743810和LAMA2基因標(biāo)記位

3、點(diǎn)rs2571575、rs9321170和rs9321170。高度近視候選基因EGR1和LAMA2的關(guān)聯(lián)分析:收集132個(gè)高度近視核心家系，每個(gè)核心家系由患高度近視的子代和他們的雙親組成，以及191例散發(fā)高度近視患者和487例正常對照。記錄屈光度數(shù)、眼軸長度(AXL)、角膜曲率(CP)和前房深度等參數(shù)。每位入選者抽取5ml靜脈血提取血液DNA，采用polymerase chain reaction-ligase detection re

4、action(PCR-LDR)法測定rs11743810、rs2571575、rs9321170和rs9321170的基因型。隨后采用FBAT(基于家系的關(guān)聯(lián)分析法)及病例-對照關(guān)聯(lián)分析法（Case-control）分析標(biāo)記SNP(tSNP)與高度近視的關(guān)聯(lián)性。
　　結(jié)果:
　　DNA序列分析顯示EGR1和LAMA2基因所測的4個(gè)tSNP位點(diǎn)在高度近視及正常人群中無顯著差異，F(xiàn)ABT研究中4個(gè)tSNP基因型分布差異P值分別0