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
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文檔簡介
1、研究目的:
胃癌是全球常見的惡性腫瘤之一,是我國第二大導致死亡的惡性腫瘤。隨著胃鏡普查、治療方案的聯(lián)合應用及分子靶向治療的發(fā)展,胃癌患者的生存期有所延長,但進展期患者的5年生存率仍不容樂觀。因此,探尋新的分子生物學標志物對于提高胃痛診斷的準確性、提供胃癌治療的新靶點以及判斷患者預后有著至關(guān)重要的意義。
COP9信號復合體(COP9 signalosome,CSN)是一種與植物光形態(tài)發(fā)生調(diào)節(jié)相關(guān)的結(jié)構(gòu)高度保守的多亞基蛋
2、白復合體,最早在擬南芥突變體中發(fā)現(xiàn)。在哺乳動物中,CSN包括八個亞單位,依次命名為CSN1~CSN8。該復合體不僅在結(jié)構(gòu)上與26S蛋白酶體的19S亞單位“蓋子”部分具有同源性,在功能上也有相似之處,故CSN在泛素化-蛋白降解途徑中具有重要的調(diào)節(jié)作用。CSN6作為CSN的一個重要亞基,涉及胚胎發(fā)育、細胞周期調(diào)控和信號轉(zhuǎn)導等多種生物學功能。近年來,隨著對CSN6研究的深入,其與腫瘤的相關(guān)性成為研究的熱點。CSN6主要通過調(diào)控泛素化介導的蛋白
3、質(zhì)降解,影響蛋白質(zhì)的穩(wěn)定性,而參與腫瘤的發(fā)生與發(fā)展。據(jù)文獻報道,CSN6在多種惡性腫瘤中呈高表達(例如:乳腺癌,卵巢癌,結(jié)腸癌),且CSN6有望成為結(jié)腸癌潛在的預后標志物。鑒于CSN6在胃癌中尚未有所報道,本研究旨在探討CSN6在胃癌細胞系和組織中的表達,分析CSN6與臨床病理參數(shù)的關(guān)系及其對胃癌患者預后的影響,為胃癌的臨床輔助診斷、靶向治療提供可靠的實驗室依據(jù)。
研究方法:
1.運用cBioportal網(wǎng)絡(luò)分析工具
4、對TCGA數(shù)據(jù)庫(Provisional數(shù)據(jù)集,Nature2014的數(shù)據(jù)集)中CSN6的基因改變頻率進行分析。
2.運用Western-blotting方法檢測CSN6在永生化的正常胃粘膜細胞株及不同胃癌細胞株中的表達情況。
3.運用Oncomine數(shù)據(jù)庫分析CSN6 mRNA在不同病理類型的胃癌組織與正常胃黏膜表達的差異性。
4.運用免疫組織化學染色的方法檢測90例胃癌及相應癌旁組織中CSN6的表達情況
5、,分析CSN6的表達與胃癌臨床病理特征之間的關(guān)系。應用Kaplan-Meier法對CSN6在胃癌組織中的表達與患者生存期之間的關(guān)系進行分析,應用Cox風險比例模型和受試者工作特征曲線(ROC曲線)對CSN6在胃癌中的診斷價值進行評估。
5.運用網(wǎng)絡(luò)在線生存期分析軟件Kaplan-Meier plotter對876例胃癌患者中CSN6mRNA的表達及其與生存期的關(guān)系進行分析。
結(jié)果:
1.對TCGA,Prov
6、isional數(shù)據(jù)集中393例胃癌患者的基因表達分析結(jié)果表明,CSN6出現(xiàn)44.8%的擴增(176/393)。對TCGA,Nature2014數(shù)據(jù)集中287例胃癌患者的基因表達分析結(jié)果表明, CSN6出現(xiàn)42.8%的擴增(123/287)。
2.Western blot檢測結(jié)果顯示,與永生化的正常胃黏膜細胞株相比,CSN6在多株胃癌細胞系中也呈高表達(差異有統(tǒng)計學意義,P<0.05)。
3.Oncomine數(shù)據(jù)庫分析
7、結(jié)果表明, CSN6 mRNA在腸型胃癌,彌漫型胃癌以及混合型胃癌中的表達水平均高于正常胃黏膜組織(P<0.05)。
4.胃癌組織免疫組織化學染色結(jié)果表明,CSN6在胃癌組織中的陽性表達率(62.2%,56/90)高于相應癌旁組織中的陽性表達率(41.4%,37/90)(P<0.05)。CSN6的表達水平與患者腫瘤大小呈正相關(guān)(P<0.05),與年齡、性別、組織學類型、浸潤深度、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移、AJCC TNM分期等指標無明顯相關(guān)
8、(P>0.05)。
5.根據(jù)本實驗免疫組織化學染色結(jié)果,用Kaplan-Meier法分析CSN6蛋白在胃癌中的表達及其與患者生存期之間的關(guān)系,結(jié)果顯示,高表達CSN6的患者生存期短于低表達的患者(P<0.05)。用Cox模型對該組患者進行單因素和多因素變量分析,結(jié)果顯示CSN6的表達水平與胃癌患者的生存期顯著相關(guān),為獨立預后因素(P<0.05)。繪制ROC曲線,評估CSN6對胃癌預后判斷的準確性,結(jié)果顯示AUC=0.622(9
9、5% CI=0.513-0.722),敏感性為71.43%,特異性為52.94%。
6.分析Kaplan-Meier plotter中876例胃癌患者的CSN6 mRNA的表達水平與總生存期的關(guān)系,結(jié)果顯示, CSN6高表達的胃癌患者比低表達的患者總生存期短(P<0.001),與免疫組化結(jié)果一致。
結(jié)論:
本研究結(jié)果表明,CSN6在胃癌細胞株及胃癌組織中均呈高表達。CSN6的表達水平與胃癌患者的生存期顯著相
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